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    • NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているRNA-seqデータを解析する

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    2024/3/24 -NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているRNA-seqデータを解析する. NCBI GEO (Gene Expression Omnibus)はNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。


    公共の遺伝子発現データの検索や解析を行う - YouTube

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    2024/3/21 -NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているRNA-seqデータを解析する · NCBI GEO を使ってRNA-seqの生データおよびカウントデータを取得する.

    Analyze publicly available RNA-seq data using NCBI GEO's GEO2Rの画像

    Analyze publicly available RNA-seq data using NCBI GEO's GEO2R

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    ... NCBI GEO (Gene Expression Omnibus)はNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベース ... 公共の遺伝子発現データの検索や解析を行う. Togotv · Playlist · 11: ...

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    【GEOparseの使い方】GEOのデータをpythonで解析する

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    2024/3/25 -本記事では、pythonのライブラリである、GEOparseを用いて、GEOのデータを取得・解析する手法について解説します。


    小野 浩雅 ONO, Hiromasa on X: "GEOに登録・公開されている ...

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    2024/3/25 -GEOに登録・公開されている遺伝子発現データを、データ解析環境 R をベースに解析できるツール GEO2Rを使って公開されているRNA-seqデータを解析する方法について紹介 ...


    RNA-seqデータの分析について勉強する - - TEST PAGE

    1. https://home.hiroshima-u.ac.jp
    2. naka
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    4. wiki
    5. RN...
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    2024/4/18 -GEO database を見てみると、イルミナ社のシーケンサーを使用している例が多い。この場合、サンプル調製には「スタンダードmRNA キット」「Total RNA キット」「Small RNA ...

    NCBI Datasetsを使ってゲノム<b>データ</b>を検索、閲覧、取得する - YouTubeの画像

    NCBI Datasetsを使ってゲノムデータを検索、閲覧、取得する - YouTube

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    TogoTV•3.1K views · 12:11. Go to channel · NCBI GEOのデータセットブラウザを使って公共データの遺伝子発現解析を行う 2019. TogoTV•6.7K views · 18:21. Go to channel ...

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    NCBI Datasetsを使ってゲノムデータを検索、閲覧、取得する - TogoTV

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    2024/3/28 -NCBI GEO を使ってRNA-seqデータを検索する · NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているマイクロアレイデータを解析する · MGIを使ってマウスの遺伝子発現情報を調べる 2019 ...


    （ヒトとマウス）仮説生成のためにクエリに最も類似した遺伝子発現 ...

    1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
    2. entry
    3. 2024/04/21
    1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
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    3. 2024/04/21

    2024/4/21 -Gene Expression Omnibus (GEO)は、トランスクリプトミクスやその他のオミックスデータセットのための主要なオープンな生物医学研究リポジトリである。


    RNAseqChef manual

    1. https://kan-e.github.io
    2. RNAseqChef_manual_japanese
    1. https://kan-e.github.io
    2. RNAseqChef_manual_japanese

    2024/2/20 -また、RNA-seqのカウントデータからChIP-seqやATAC-seqの解析で得た遺伝子セットを抽出・解析するマルチオミクスな解析も可能です。 Publication-readyな高解像度Figure（ ...