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  • 最終更新日：6か月以内

    • 井上 潤：遺伝子の切り出し

    1. https://fish-evol.org
    2. gene_strip

    2024/4/13 -Accession number を一つのファイルに保存しておけば，以下の「学名をリストアップして一気にデータを集める」に書いている Batch Entrez を使った方法で GenBank format ...


    Search NCBI databases - NLM

    1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov
    2. search

    3日前 -Search all biomedical databases provided by the National Center for Biotechnology Information (NCBI), an agency of the U.S. National Library of Medicine at ...


    BioProject - DDBJ - 国立遺伝学研究所

    1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
    2. bioproject

    2024/5/21 -INSDC が運営するデータベースに登録されたデータが BioProject アクセッション番号を引用することで、データがプロジェクト単位でグループ化されます。 DDBJ BioProject ...


    NCBI Datasetsを使ってゲノムデータを検索、閲覧、取得する - TogoTV

    1. https://togotv.dbcls.jp
    2. ...

    2024/3/28 -遺伝子配列や制限酵素サイトの検索、2種類の配列のアライメントなどが簡単にできます。 ... Accession ID: PRJNA254790)を例として、RaNA-seqの使い方を紹介します ...


    RNA-seqデータの分析について勉強する -

    1. https://home.hiroshima-u.ac.jp
    2. naka
    3. wiki
    4. wiki

    2024/4/18 -html をブラウザで開き、Search -> Accession number で検索する。 Accession number は NCBI GEO database で調べられる。検索するとファイルの情報は出てくるが、SRR ...


    Advanced Searchで様々な条件でPDBファイルを検索する

    1. https://www.altif-labs.com
    2. site
    3. how-to-pdb6

    2024/5/30 -テキスト検索だけでなく、アミノ酸配列のモチーフや、化合物、DNAやRNAとの複合体の状態等、条件を選択して検索することができます。 検索条件を追加して、複数の条件 ...


    Sequence Read Archive - DDBJ - 国立遺伝学研究所

    1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
    2. dra

    2024/6/10 -DDBJ Sequence Read Archive (DRA) は科学研究の再現性担保、及び、データ解析による新たな発見を支えるために生シークエンスデータとアライメント情報をアーカイブしてい ...

    DRA の登録-データファイル-登録概要-メタデータの例


    EDGAR—Search and Access - SEC.gov

    1. https://www.sec.gov
    2. edgar
    3. search-and-access

    2024/2/27 -New versatile tool lets you search for keywords and phrases in over 20 years of EDGAR filings, and filter by date, company, person, filing category, ...


    National Center for Biotechnology Information

    https://www.ncbi.nlm.nih.gov

    2024/6/20 -The National Center for Biotechnology Information advances science and health by providing access to biomedical and genomic information. About the NCBI | ...

    Nucleotide BLAST-Nucleotide-Gene-Submission Portal


    Q：PubMed IDのリストから文献情報を作成する方法 | EndNote（文献管理

    1. https://rs.usaco.co.jp
    2. product
    3. endnote
    4. faq

    2024/1/22 -手順2のリストの項目を [Accession Number] から [DOI] に変更し、DOI の値を入力することで、同様の手順で文献情報を作成することができます。 ※ 文献情報を取得できるの ...