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NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
ホモロジー検索（相同性検索）とは？ MIGMMIT. MMIGPIT. MDIGIT. MYLGPST. MMIQPMMDG ... これらと相同なアミノ酸配列がMgenitalium.faa内にあるか. どうかを調べるために ...
ホモロジー (homology). 相同性をさす。同一性 (identity) は一致性をさす。例えばアミノ酸配列間のホモロジー (相同性) をいう場合、同じ性質を持つアミノ酸 ...
blastp. アミノ酸配列を問い合わせ配列として、アミノ酸配列データベースから相同性を持つ配列（エントリ）を検 ... ホモロジー検索が可能です。 次に中央部の青四角で囲んだ ...
最初に，相同性（homology）の概念について解説します。単に相同性と言っても，様々です。2本の配列を比較したときに，連続した5個のアミノ酸のみが完全に一致して ...
構造予測を行うタンパク質のアミノ酸配列を，立体構造データベースのアミノ酸配列に対してホモロジー検索を行い，もし立体構造既知のタンパク質と有意な配列ホモロジー ...
この方法は「相同性（ホモロジー）検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列（クエリー配列といいます）と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
2015/2/20 -原理 : 立体構造はアミノ酸配列より保存しやすい. 立体構造データベースの中から、クエリ配列に. 最も適合する構造（テンプレート構造）を探す.
... アミノ酸. 残基がどこに配置されているか確認する。 5.4 ホモロジー検索. 【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、.
2021/4/7 -相同性検索 （ホモロジー検索）. ▫ 相同性検索は，配列の類似性から類縁の ... これらと相同なアミノ酸配列を M. genitaliumが持っているかどう. かを ...
Q.アミノ酸配列の相同性に関する質問です。 2つのアミノ酸全体間でのホモロジー(%)を計算するのに良いソフトまたはサイトはないでしょうか？ GENETYX ver.10のアミノ酸×アミノ酸ホモロジ...
A.たしかに。 GENETYXやBLASTは相同領域だけの計算ですね。 はい、これを解決しやすいのはalignment programです。 ExPASyの中の各サイトを試して見てはいかがでしょうか。
Q.ホモロジーモデリングに用いられるMODELLERプログラムについての質問です。 MODELLERプログラムはBLASTを用いていると書いてありましたが、 どのように用いているのでしょうか。 目...
A.質問がよくわからないです。 Eswar et al.のFigure 2.9.7にある２つの配列ではなく複数の配列からなるマトリクスファイルと比較するということでしょうか。 ひとつひとつ、チュー...
A.質問者様の理解でよろしいかと思います。 二つのタンパク質が「100％ホモロジーあり」ならば、二つのタンパク質は全く同一の蛋白質であり、「50％ホモロジーあり」であれば、アミノ酸配列の半分が共通...