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Q.アミノ酸配列の相同性に関する質問です。 2つのアミノ酸全体間でのホモロジー(%)を計算するのに良いソフトまたはサイトはないでしょうか？ GENETYX ver.10のアミノ酸×アミノ酸ホモロジ...
A.たしかに。 GENETYXやBLASTは相同領域だけの計算ですね。 はい、これを解決しやすいのはalignment programです。 ExPASyの中の各サイトを試して見てはいかがでしょうか。
Q.ホモロジーモデリングに用いられるMODELLERプログラムについての質問です。 MODELLERプログラムはBLASTを用いていると書いてありましたが、 どのように用いているのでしょうか。 目...
A.質問がよくわからないです。 Eswar et al.のFigure 2.9.7にある２つの配列ではなく複数の配列からなるマトリクスファイルと比較するということでしょうか。 ひとつひとつ、チュー...
A.質問者様の理解でよろしいかと思います。 二つのタンパク質が「100％ホモロジーあり」ならば、二つのタンパク質は全く同一の蛋白質であり、「50％ホモロジーあり」であれば、アミノ酸配列の半分が共通...