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BLASTは、Basic Local Alignment Search Tool の略で、ペアワイズの局所的なアライメント／相同性検索（ホモ. ロジー検索）を比較的高速に行うプログラムのことを指し ...
2017/3/21 -塩基配列を問い合わせ配列として、nr/ntデータベース（冗長性を排した塩基配列データベース）に対して検索を行い、機能を推定する使い方を説明します。
らのDBに登録して，その登録番号（accession number） ... ンとは注釈情報のことで，この場合はゲノム上のその位. 置 ... blast.ncbi.nlm.nih.gov/ (2016/11/29). 3) DDBJ ...
BlastやFastaが塩基配列やアミノ酸配列からスタートするのに対して、キーワードや、Accession numberなどをもとに検索する場所です。検索できる主要なデータベースは以下の ...
2007/8/8 -塩基配列を問い合わせ配列として、nr/ntデータベース（冗長性を排した塩基配列データベース）に対して検索を行い、機能を推定する使い方を説明します。
INSD (the International Nucleotide Sequence Databases; 国際塩基配列データベース) とは ... UniProt accession numbers: 例 P12345, Q01234. Related pages. 登録データ ...
2023/6/20 -もう少し使いやすいように、NCBI Accession Numberをキーとして、SILVAなどで採用されている複数の分類階級を記載する形式に変換してみよう。というのが ...
ここでは例題塩基配列を用いてblastxで類似配列の検索を行った例を示す。 手順1. "分子生物学研究用ツール集" の "ホモロジー検索" の項目のところの "BLAST" をクリック ( ...
2014/8/4 -Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402 ...
検索結果が得られたら，そのに書かれている accession number をもとに，fastacmd によって配列を得ることができます． cDNA データを哺乳類だけから集める 1. Local Blast ...