2024/3/24 -今回はGEOの使い方第3弾として、データセットブラウザ(Dataset browser)を利用して、一つの実験データセットにおける様々な遺伝子発現を詳細に調べる方法を紹介しています ...
2日前 -理解して使うRNA Velocity解析ツール -最近のツールの紹介- · GitHub Release ... 遺伝子発現変動解析（DEG解析）に不可欠なツールである。原著論文で使用されたRNA ...
2024/5/20 -こちらはGene Ontology (GO)のデータベースに対してのエンリッチメント解析となっております。実は、clusterProfilerでは、他のDBを使うことも可能で、特定の遺伝子セット ...
2024/4/3 -DNAからRNAへの転写、RNAからタンパク質への翻訳のプロセス、そして生物の形質を決定する流れについて、rhelixaの解説と共に、生物学や遺伝子工学の基礎をわかりやすく紹介 ...
2024/5/1 -これらの情報を総合すると、この論文は、タンパク質のデータベース解析、空間遺伝子発現パターンの解析、およびそれらに関連する機械学習モデルの適用と最適化に焦点を当て ...
2024/1/12 -我々は、哺乳類の組織や細胞株を様々な方法で測定した参照遺伝子発現パターンを閲覧するためのウェブツールを開発した。これにより、いくつかの公開データベースに保存され ...
2024/4/21 -現在、RummaGEOには、23,395件のGEO研究から抽出された135,264のヒトと158,062のマウスの遺伝子セットが含まれている。次に、RummaGEOデータベースの内容を解析し、統計的 ...
2024/5/16 -... ゲノム変異などの注釈づけ情報を統合し、遺伝子発現制御に関わるエピゲノム状態の変容を検出する比較解析ツールを実装しました。これにより、ChIP-Atlasは世界最大規模 ...
2024/6/19 -... 遺伝子発現制御に関わるエピゲノム状態の変容を検出する比較解析ツール Diff Analysis を実装しました。これにより、ChIP-Atlas は高度な解析機能を備えた世界最大規模 ...
2024/5/20 -本章では、scRNA-seqデータのfastqファイルをCell Rangerで処理して、barcode, feature, matrixファイルを得る手順を紹介していきたいと思います。 その後、実践編として ...