2023/12/13 -RNAseqChefは、RNA-seq解析により得られたカウントデータを自動的に解析・可視化するツールである。RNAseqChefを用いることで、単一のデータセットの解析のみならず、複数 ...
2024/3/20 -「GENEVESTIGATOR」は、遺伝子発現データベースのまったく新しい解析ツールです。公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現 ...
2023/10/30 -NCBI GEO (Gene Expression Omnibus)はNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。GEOには、主にRNA-seqやマイクロアレイ実験で得られたデータが ...
本講演の要旨は以下の通りです。 「RNAシーケンス（RNA-seq）は網羅的な遺伝子発現変動解析（DEG解析）に不可欠なツール ... 紹介04:02 4. 解析例1: 二群間の比較解析 ...
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2023/10/28 -GEO2Rは、ユーザーが GEO シリーズ内の 2つ以上のサンプルグループ（群）を比較して、群間で発現差がある遺伝子を特定できるWebツールです。ブラウザを使用して探索した ...
... 遺伝子発現変動解析) の使い方について詳細に解説します。 合わせて、「RNAseqChef: 遺伝子発現変動を自動的に可視化するRNA-seq統合解析ツール @ 日本エピジェネ ...
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2023/11/22 -遺伝子発現プロファイルの動的な変化をモデル化することで、細胞の発生軌跡を再. 構築する計算アプローチです。 エンリッチメント解析. グループ間の異なるエンリッチ ...
2024/1/12 -我々は、哺乳類の組織や細胞株を様々な方法で測定した参照遺伝子発現パターンを閲覧するためのウェブツールを開発した。これにより、いくつかの公開データベースに保存され ...
2023/9/22 -遺伝子発現量の定量には、通常のマッピング処理を行わないアルゴリズムであるSalmonを用いています。従来のマッピング処理 → リードカウントでは解析に時間がかかるため、 ...
2024/5/20 -実は、clusterProfilerでは、他のDBを使うことも可能で、特定の遺伝子セットやタンパク質セットが、どのような生物学的プロセスやパスウェイに関与しているかを調査する ...