保存された配列から共通のモチーフを見つけ出すことでタンパク質間での機能の類似を見つけだし、未知のタンパク質の機能や機能部位を推定することができます。 例えば、 ...
見つけ方 · 1ゲノムの中で共発現してる遺伝子のプロモーターを集めて高頻度な部分配列を探す · 複数種のorthologousな遺伝子のプロモーターを集めて特に保存的な部分配列を ...
2020/12/17 -STREMEは、選択した停止基準を満たすまで、以下の5つのステップを繰り返してモチーフを検索する。停止基準は、モチーフの統計的有意性（p値）、または ...
配列アライメント. データベースサーチ. タンパク質機能・立体構造予測. 配列モチーフ・隠れマルコフモデル. メタゲノム解析（緒方）. 分子進化・分子系統解析（緒方）.
モチーフ検索サーバー。 アミノ酸配列に関してはProfilefindによるプロファイル検索とHmmpfamによるHMM検索が可能である。DBとしてはPROSITE Pattern、Skip entries with ...
ホモロジー検索では配列ど. うしのマッチングを行い，動的プログラミング法など. により適当に「ギャップ」を挿入しながら，（照合す. る要素が多いという意味で）似ている ...
配列をモチーフで検索できます。 CDR配列の基、特定のペプチドパターン、またはSNPの検索がこれまでになく簡単になりました。 Motif の書き方ルール.
ヒトのアポトーシス関連遺伝子 BCL2 のアミノ酸配列中にどんなモチーフがあるか、MOTIF および Pfam で検索する。 手順：MOTIF. DBGET でアミノ酸配列データベース ...
• それらを特徴づける配列パターン（モチーフ）を登録し、その検索機能をもつ. • ファミリーに特徴的な機能やドメインの構造を記述したドキュメンテーションエン. トリー ...
アミノ酸のコンセンサス配列をHMM形式に変換し検索するためのパッケージである。 マルチプルアライメントからHMMを生成するプログラム・入力されたアミノ酸配列とHMMと ...