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    • 井上 潤：遺伝子の切り出し

    1. https://fish-evol.org
    2. gene_strip
    1. https://fish-evol.org
    2. gene_strip

    2024/4/13 -Accession number を一つのファイルに保存しておけば，以下の「学名をリストアップして一気にデータを集める」に書いている Batch Entrez を使った方法で GenBank format ...


    アクセッション番号等によるエントリ検索 - DDBJ

    1. https://getentry.ddbj.nig.ac.jp
    2. top-j
    1. https://getentry.ddbj.nig.ac.jp
    2. top-j

    2023/11/1 -アクセッション番号等によるエントリ検索. ID : DNA データベース : DDBJ / EMBL / GenBank. MGA, 出力形式 : フラットファイル(DDBJ), 全塩基配列 FASTA ...


    第2章 ゲノム情報解析(発展編)

    1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
    2. textbook
    3. chapter2

    2023/9/17 -2.3.1 ゲノム情報の可視化(ゲノムブラウザ). ゲノム(genome) ... 修飾を受けたゲノムのことです。 遺伝子(gene) ... これ(HZ245980.1)はGenBankのaccession番号です。


    NCBI GEO を使ってRNA-seqデータを検索する | TogoTV

    1. https://togotv.dbcls.jp
    2. ...
    1. https://togotv.dbcls.jp
    2. ...

    2023/8/17 -それらの中から、自分の興味のある発現データセットや遺伝子プロファイルを検索することができるだけでなく、それらの生データを自由にダウンロードすることが可能です。


    NCBI 16s rRNAのBLAST DBを複数階級の情報をもつ形式に変換して ...

    1. https://edna-blog.com
    2. データの解析方法
    1. https://edna-blog.com
    2. データの解析方法

    2023/6/20 -もう少し使いやすいように、NCBI Accession Numberをキーとして、SILVAなどで採用されている複数の分類階級を記載する形式に変換してみよう。というのが今回の内容になり ...


    RNAseqChef manual

    1. https://kan-e.github.io
    2. RNAseqChef_manual_japanese
    1. https://kan-e.github.io
    2. RNAseqChef_manual_japanese

    2024/2/20 -また、RNA-seqのカウントデータからChIP-seqやATAC-seqの解析で得た遺伝子セットを抽出・解析するマルチオミクスな解析も可能です。 Publication-readyな高解像度Figure（ ...


    RNA-seqデータの分析について勉強する - - TEST PAGE

    1. https://home.hiroshima-u.ac.jp
    2. naka
    3. wiki
    4. wiki
    1. https://home.hiroshima-u.ac.jp
    2. naka
    3. wiki
    4. wiki

    2024/4/18 -Accession number は NCBI GEO database で調べられる。 ... DNA in the Arabidopsis thaliana Nuclear Genome'' Genome Biol Evol. ... 遺伝子が核ゲノムにも存在する。


    NCBI GEO を使ってRNA-seqの生データおよびカウント ... - Togo TV

    1. https://togotv.dbcls.jp
    2. ...
    1. https://togotv.dbcls.jp
    2. ...

    2023/10/30 -それらの中から、自分の興味のある発現データセットや遺伝子プロファイルを検索することができるだけでなく、それらの生データを自由にダウンロードすることが可能です。


    植物の遺伝的多様性から気候変動に適応するためのメカニズムを理解する

    1. https://kaken.nii.ac.jp
    2. grant
    1. https://kaken.nii.ac.jp
    2. grant

    2023/12/25 -そこで本研究では、シロイヌナズナに見られる浸透圧および高温耐性の遺伝的多様性から植物のストレス適応メカニズムを理解することを目的に、多様性を決定する鍵遺伝子の ...


    RNA-Seq 遺伝子発現解析 - 北海道システム・サイエンス

    PDF
    1. https://hssnet.co.jp
    2. wp-content
    3. uploads
    4. 2023/09
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    1. https://hssnet.co.jp
    2. wp-content
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    4. 2023/09

    2023/10/5 -GO Gene Ontology. 発現変動遺伝子群と関連性の高いGO を探索します。 GO Accession. GO Term p-value. GO:0044802 single-organism membrane organization 8.37E-12. GO ...