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データベース検索(ホモロジー検索). ホモロジー検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で,進化・系統分類の解析,機能解析などを目的とした.
2015/7/14 -NCBIが提供するHomoloGeneは、真核生物間の相同的な遺伝子を検索するツールです。種間比較や系統樹作成のために、興味のある相同遺伝子を一括で取得 ...
... ホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。以前はギャップを考慮しなかったためアミノ酸配列のホモロジー検索ではFASTAを使う人も多かったが ...
... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。
検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER
【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、. データベース中にあるかどうかを調べることである。遺伝子 A と高い相同性 ...
Q.同じ遺伝子を動物種間で比較するのがホモロジーですよね? 何%の相同性があるか知りたいんですが、Blastnでその数値は確認できますか? たとえば、トカゲなんかの遺伝子配列をマウスなどと比較すると...
A.>同じ遺伝子を動物種間で比較するのがホモロジーですよね? ホモロジー(似具合)の比較は同じ遺伝子である必要はなくて違う遺伝子との比較もあります。 同じ遺伝子(オーソログ)を比較すること...
Q.某大学でバイオテクノロジーについて学んでいます そこで質問なんですが、 ホモロジー検索について謝ってるものはどれかという問題で、 1.ホモロジーが高ければ、共通の祖先遺伝子に由来する可能性が高い 2
A.hobbygogさん 誤っているのは4番です。 FASTA や BLAST は、データベースではなくホモロジー検索を行なう プログラムの名前です。 DNA やアミノ酸配列を取り扱うプログラムで、
Q.来週、進級のかかったテストがあります。実習のテストなんですがどんな問題が出るか見当がつきません。生徒などに教えてる側の人にできればアドバイスもらいたいです。 実習の内容なんですが分子生物の実習で...
A.最低限押さえておくべき所だろうなぁ、と思う点をいくつか書いてみます。 ・DNA組み換えに必要な酵素とその動態、機構…制限酵素とか、DNAリガーゼとかがどう作用するか。 ・形質転換(トランスフォ...
ホモロジーサーチは検索者が指定したDNAや蛋白の配列に近いものをデータベースの中から捜し出すという作業です。配列がぴったし一致するなら、UNIXのgrepや宮沢さんの作っ ...
... 遺伝子の一部を含んだものです。 ... 問い合わせ配列として与えられた配列を入力し①、 そのほかはデフォルトのままでBLATボタンをクリックする②ことでホモロジー検索を実施 ...
以上の操作で得られたラクトフェリンのアミノ酸配列データと似た配列を持つタンパク質が他にあるかどうかを検索してみます。この方法は「相同性(ホモロジー)検索」と ...
NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...