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配列データベースとホモロジー検索

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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. lectures
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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. lectures

ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした ... BLAST検索の際にE valueのしきい値 ...


NCBI BLASTチュートリアル

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  1. https://www.jst.go.jp
  2. minicourses
  3. blast-tutorial
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  1. https://www.jst.go.jp
  2. minicourses
  3. blast-tutorial

BLASTは、Basic Local Alignment Search Tool の略で、ペアワイズの局所的なアライメント／相同性検索（ホモ. ロジー検索）を比較的高速に行うプログラムのことを指し ...


BLASTクイックスタート

  1. https://www.jst.go.jp
  2. nbdc
  3. bird
  4. minicourses
  5. blast
  1. https://www.jst.go.jp
  2. nbdc
  3. bird
  4. minicourses
  5. blast

このミニコースでは、配列相同性検索プログラムであるBLASTファミリについて実用的な紹介をしていきます。その課題は単純な探索から、ある特別な目的の探索をBLASTの ...


相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ

  1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
  2. activities
  3. blast-doc
  1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
  2. activities
  3. blast-doc

BLASTの検索によって発見できるのは，高い局地的相同性を持つ配列です。高い全体的相同性を持つ配列も，問題なく発見できます。低い局地的相同性を持つ配列を発見できるか ...


生物配列解析基礎

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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. lectures
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2021/4/7 -▫ 相同性検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を検索する. 方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした配列解析の. 最も基本 ...


I．構造編-11．データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ

  1. https://www.cosmobio.co.jp
  2. technology
  3. milk-protein-12
  1. https://www.cosmobio.co.jp
  2. technology
  3. milk-protein-12

以上の操作で得られたラクトフェリンのアミノ酸配列データと似た配列を持つタンパク質が他にあるかどうかを検索してみます。この方法は「相同性（ホモロジー）検索」といい ...


NCBI BLASTの使い方 〜基本編〜 2017 | TogoTV

  1. https://togotv.dbcls.jp
  2. ...
  1. https://togotv.dbcls.jp
  2. ...

2017/3/21 -NCBI BLAST(えぬしーびーあいブラストと発音します)は、問い合わせ配列に類似した配列をデータベース中から検索するツールです。BLASTの名称はBasic Local ...


BLASTの使い方 - ゼータテクノロジー合同会社

  1. https://zetatechnology.co.jp
  2. blastの使い方
  1. https://zetatechnology.co.jp
  2. blastの使い方

BLASTは、Basic Local Alignment Search Tool の略で、ホモロジー検索を行うためのツールです。WEBサイト上でBLASTを利用することもできますが、独自のデータベースで検索 ...


③配列を比較したいとき - 遺伝子配列の検索や比較に役立つwebツール ...

  1. https://guides.lib.kyushu-u.ac.jp
  2. alignment

2023/10/18 -取得した塩基配列(もしくはアミノ酸配列)と相同性のある配列（似た配列）を検索したいときによく使用されるのが、BLAST(Basic Local Alignment Sarch ...


ホモログ及びオルソログタンパク質を検索するwebデータベース orthoFind

  1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
  2. entry
  3. 2019/06/02
  1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
  2. entry
  3. 2019/06/02

2019/6/2 -ホモログを検索するとき、最初の選択は通常相同性検索のための標準的なツール、BLAST [ref.5]である。しかし、ホモログと見なされるすべての配列を収集し ...