生物情報学（バイオインフォマティクス）や、ゲノム科学などで使われる解析手法で、一定のアルゴリズムに基づき、異なる分子間のアミノ酸配列やヌクレオチド配列の類似性に ...
Smith-Waterman法は データベース中のすべての配列との間で忠実にアラインメントを行なってホモロジースコアを算定する。BLASTやFASTAで見落とすような弱い類似性も拾える ...
ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...
... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。
配列解析の基本的な手法であるホモロジーサーチがいかにして類似配列をデータベース中に検索するのか， 本稿ではその利用法も含めて紹介する． 【キーワード】 ゲノム計画 ...
【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、. データベース中にあるかどうかを調べることである。遺伝子 A と高い相同性 ...
NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
この方法は「相同性（ホモロジー）検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列（クエリー配列といいます）と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
... 検索するソフトが BLASTX です。 (1) BLAST によるホモロジー検索 さて，いよいよ検索です。 検索するためには，自分の配列を BLAST による検索の画面に入力しなければ ...
... 検索し、 機能や立体構造を推測するという手法が用いられています。この検索を一般に相同性検索（ホモロジー検索）といいます。 □ 相同性検索プログラム. 「類似性の ...