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  • 2023/9/4 -リンク先は「相同性」です。調べたい配列(塩基配列またはアミノ酸配列)が共通の祖先に由来するかどうかを調べることです。ホモロジー検索ともよばれます。

    2023/10/18 -取得した塩基配列(もしくはアミノ酸配列)と相同性のある配列(似た配列)を検索したいときによく使用されるのが、BLAST(Basic Local Alignment Sarch Tool)です。

    2023/10/11 -ここからアミノ酸配列のマルチ FASTA 形式を取得することができる。 別の例として麹菌の遺伝子 AN7028.2 のホモロジー検索をして、機能割り当てをしてみよう。

    2023/11/1 -2つゲノムの間の最大相同性パスに沿った相同性領域の比較を塩基配列やアミノ酸配列レベルでかつそれらゲノム上にある注釈を表示します。 ... 機能と特徴. 基準となるゲノム ...

    2024/6/7 -特に,ホモロジーサーチ法を解説し,その手法で広く使われているソフトウエアBLASTについて使い方も含めて紹介する。また,遺伝子配列に対し,機能などの情報をつけて ...

    2024/7/28 -相同性(そうどうせい)あるいはホモロジー (英語: homology) とは、ある形態や遺伝子が共通の祖先に由来することである。 外見や機能は似ているが共通の祖先に由来 ...

    2023/10/20 -現象:ホモロジー検索を実行しようとすると「Please set up NCBI blast path」というエラーメッセージが表示され、実行できない。 原因:NCBI Blast のパス設定がない ...

    2024/7/22 -The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to ...

    Nucleotide BLAST-Standard Protein BLAST-(human) Nucleotide BLAST-Blastx

    2024/8/8 -5章:ゲノム配列情報の意味を解読する方法をいくつか紹介する。特に,ホモロジーサーチ法を解説し,その手法で広く使われているソフトウエアBLASTについて使い方も含めて ...

    2024/5/16 -立体構造モデリングの手法としてホモロジー・モデリング法が有用に使われている。 ... それだけ多くのゲノム配列データからサーチしていることを示している。