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- Gsea 解析ソフトではありませんか？
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検索結果
https://togotv.dbcls.jp/20190403.html NCBI GEO (Gene Expression Omnibus)はNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。
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2019/03/25動画の見どころ1/9枚目 1. GEOデータベースで、検索を行う
動画の見どころ2/9枚目 2. 遺伝子発現量のデータから、特定の遺伝子を検索する
動画の見どころ3/9枚目 3. 遺伝子発現量のデータを用いて、解析を行う
動画の見どころ4/9枚目 4. サンプル内容とIDの対応を調べる
動画の見どころ5/9枚目 5. 解析したデータをダウンロードする
動画の見どころ6/9枚目 6. 染色体の位置毎の遺伝子発現量を調べる
動画の見どころ7/9枚目 7. サンプルデータを使って、遺伝子発現量解析を行う
動画の見どころ8/9枚目 8. サンプルの情報の詳細を調べる
動画の見どころ9/9枚目 9. サンプル間で有意な発現差がある遺伝子を調べる.togotv#DBCLS#bioinformatics #togotv#DBCLS#bioinformatics
GEOに登録されているマイクロアレイ実験のデータを、フリーのデータ解析環境 R をベースに解析できるツール GEO2Rの使い方を紹介します。 GEO2Rを使っ ...
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2021/02/11... GEO を使ってRNA-seqデータを検索する00:10 1. NCBI GEO ... NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているマイクロアレイデータを解析する ... ウェブツールを使っ ...
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2023/08/17... GEOに登録されているRNA-Seqデータを再利用するための処理済みデータと各種解析ツールを提供しているウェブツールです。(原著論文: GREIN: An ...
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2020/01/23... GEO を使ってRNA ... ブラウザ上でRNA-seqデータを解析する @ AJACSオンライン14 ... バイオインフォマティクスツール・パッケージを自作する.
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2023/10/23動画の見どころ1/10枚目 NCBI GEO を使ってRNA-seqの生データおよびカウントデータを取得する
動画の見どころ2/10枚目 1. Homebrewのインストール
動画の見どころ3/10枚目 2. SRA Toolkitのインストール
動画の見どころ4/10枚目 3. Pigzのインストール
動画の見どころ5/10枚目 4. ディレクトリの作成
動画の見どころ6/10枚目 5. RNA-seqデータのダウンロード
動画の見どころ7/10枚目 6. 複数のRNA-seqデータのダウンロード
動画の見どころ8/10枚目 7. fastqファイルへの変換
動画の見どころ9/10枚目 8. 複数のファイルをfastqへの変換
動画の見どころ10/10枚目 9. pigzによるfastqファイルの圧縮
... ツール GEO2R https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/ を使って公開されているRNA-seqデータを解析する方法について紹介します。GEO2Rの利用はこれ ...
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2024/03/24動画の見どころ1/9枚目 NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているRNA-seqデータを解析する
動画の見どころ2/9枚目 1. GEO2Rについて
動画の見どころ3/9枚目 2. GEO2Rの使い方について
動画の見どころ4/9枚目 3. 解析結果の表から処理区ごとの遺伝子発現パターンを確認する
動画の見どころ5/9枚目 4. カラムの追加および解析結果のダウンロード方法について
動画の見どころ6/9枚目 5. 解析結果の図表から処理区ごとの遺伝子発現パターンを確認する
動画の見どころ7/9枚目 6. 解析手法の詳細な設定変更について
動画の見どころ8/9枚目 7. Profile graphを利用して特定の遺伝子発現プロファイルを確認する
動画の見どころ9/9枚目 8. 解析で利用したR scriptを確認する
/20170102.html NCBI GEO(Gene Expression Omnibus; 「ジオ」あるいは「ゲオ ... The Cancer Genome Atlas (TCGA) を使って各癌種の公開データを解析する.
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2017/02/24... 解析をデータセットブラウザで行います。データセットブラウザ中のデータセット解析ツールで、注目したい遺伝子の検索や、階層的、非階層的な ...
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2009/03/06http://togotv.dbcls.jp/20180501.html NCBI GEO (Gene Expression Omnibus)はNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。
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2018/05/09http://togotv.dbcls.jp/20180405.html NCBI GEOはNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。今回はGEOの使い方第5弾 ...
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2018/04/13動画の見どころ1/7枚目 1. GEO のトップページから口腔粘膜のトランスクリプトームを測定したデータセットを探す
動画の見どころ2/7枚目 2. 各サンプルを比較したい 2 群に分ける
動画の見どころ3/7枚目 3. データのクオリティを調べる
動画の見どころ4/7枚目 4. 2 群間で異なる発現パターンを示した遺伝子を確認する
動画の見どころ5/7枚目 5. P 値の計算方法を変更する
動画の見どころ6/7枚目 6. プローブ ID から任意の遺伝子の発現を確認する
動画の見どころ7/7枚目 7. これまでの操作を R のスクリプトで表示する.togotv#DBCLS#bioinformatics #togotv#DBCLS#bioinformatics
... GEOの使い方第5弾として、GEOに登録されているマイクロアレイ実験のデータを、Rをベースに解析できるツールGEO2Rの使い方を説明しています。実験に使 ...
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2012/05/23Comments · NCBI GEOの使い方2～遺伝子プロファイルの検索・処理済みデータの取得～ · 公共の遺伝子発現データの検索や解析を行う · The Cancer Genome Atlas ...
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2012/01/26本家はこちら http://togotv.dbcls.jp/20100326.html#p01 NCBI GEO(Gene Expression Omnibus)は、遺伝子発現バンクとして、主にマイクロアレイデータ ...
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2011/09/28... (GEO)からマイクロアレイの生データをダウンロードする方法で取得したものを用いています。また、マイクロアレイデータの正規化手法はさまざまなものが ...
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2009/03/20NCBI GEOの使い方3 データセットブラウザの使い方1 · NCBI Datasetsを使ってゲノムデータを検索、閲覧、取得する · 公共の遺伝子発現データの検索や解析を ...
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2012/02/26... GEOより取得した公共の遺伝子発現データ（GSE1657:Adipocyte Differentiation [Homo sapiens]）を用いて、ヒトの脂肪細胞の分化過程で発現増加した ...
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2009/09/24公共の遺伝子発現データの検索や解析を行う. Togotv · Playlist · 11:46. Go to channel · NCBI Datasetsを使ってゲノムデータを検索、閲覧、取得する.
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2009/02/20... softwareはBroad Instituteによって実装されたGSEAを行うソフトウェア ... 解析方法・結果の閲覧方法を解説しました。今回は、NCBI GEO ... ソフトを使い加工 ...
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2010/08/27... 解析（DEG解析）に不可欠なツールである。原著論文で使用されたRNA-seqのデータセットは誰でも再利用できるようにGene Expression Omnibus（GEO）に ...
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2023/12/12動画の見どころ1/14枚目 RNAseqChef: 遺伝子発現変動を自動的に可視化するRNA-seq統合解析ツール
動画の見どころ2/14枚目 2. RNA-seq解析の概要
動画の見どころ3/14枚目 3. RNAseqChef の紹介
動画の見どころ4/14枚目 4. 解析例1: 二群間の比較解析(Pair-wise DEG)
動画の見どころ5/14枚目 5. Pair-wise DEG の補足
動画の見どころ6/14枚目 6. 解析例2: 複数のデータセットの統合解析(Pair-wise DEG + Venn diagram)
動画の見どころ7/14枚目 7. Venn diagramの補足
動画の見どころ8/14枚目 8. 解析例3: 時系列データの多重比較解析(Multi DEG)
動画の見どころ9/14枚目 9. 解析例4: 相関解析(Normalized count analysis)
動画の見どころ10/14枚目 10. 相関解析の補足
動画の見どころ11/14枚目 11. 解析例5: エンリッチメント解析(Enrichment viewer)
動画の見どころ12/14枚目 12. 解析例6: Public data の解析(GREINとの連携)
動画の見どころ13/14枚目 13. 補足: Public dataの解析
動画の見どころ14/14枚目 14. まとめ: RNAseqChefを使用する利点
/20090213.html#p01 NCBI GEOはNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。 今回はGEO ... 解析を行う. TogoTV•305 views · 6:39. Go ...
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2009/02/13