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検索結果
GEOに登録されているマイクロアレイ実験のデータを、フリーのデータ解析環境 R をベースに解析 ... データを、フリーのデータ ... 】家建ててから、ずっと悩ん ...
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2021/02/11... GEOデータベースで、検索を行う (0:50) 2. 遺伝子発現量のデータから、特定の遺伝子を検索する (1:50) 3. 遺伝子発現量のデータを用いて、解析を行う ...
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2019/03/25動画の見どころ1/9枚目 1. GEOデータベースで、検索を行う
動画の見どころ2/9枚目 2. 遺伝子発現量のデータから、特定の遺伝子を検索する
動画の見どころ3/9枚目 3. 遺伝子発現量のデータを用いて、解析を行う
動画の見どころ4/9枚目 4. サンプル内容とIDの対応を調べる
動画の見どころ5/9枚目 5. 解析したデータをダウンロードする
動画の見どころ6/9枚目 6. 染色体の位置毎の遺伝子発現量を調べる
動画の見どころ7/9枚目 7. サンプルデータを使って、遺伝子発現量解析を行う
動画の見どころ8/9枚目 8. サンプルの情報の詳細を調べる
動画の見どころ9/9枚目 9. サンプル間で有意な発現差がある遺伝子を調べる.togotv#DBCLS#bioinformatics #togotv#DBCLS#bioinformatics
https://togotv.dbcls.jp/200126.html GREIN（GEO RNA-Seq Experiments Interactive Navigator）は、GEOに登録されているRNA-Seqデータを再利用する ...
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2020/01/23... から、自分の興味のある発現データセットや遺伝子プロファイルを検索することができるだけでなく、それらの生データを自由にダウンロードすることが ...
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2017/02/24https://doi.org/10.7875/togotv.2023.056 NCBI GEO (Gene Expression Omnibus)はNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。
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2023/08/17NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているマイクロアレイデータを解析する ... データの遺伝子発現解析 ... OmicsDI を使って様々なデータベースからオミクス ...
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2024/03/21... 解析できるツール GEO2R の使い方を説明します。 GEOに登録されているデータから、それぞれのサンプルを発現量の差を調べたいグループに分け、検定の ...
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2018/04/13動画の見どころ1/7枚目 1. GEO のトップページから口腔粘膜のトランスクリプトームを測定したデータセットを探す
動画の見どころ2/7枚目 2. 各サンプルを比較したい 2 群に分ける
動画の見どころ3/7枚目 3. データのクオリティを調べる
動画の見どころ4/7枚目 4. 2 群間で異なる発現パターンを示した遺伝子を確認する
動画の見どころ5/7枚目 5. P 値の計算方法を変更する
動画の見どころ6/7枚目 6. プローブ ID から任意の遺伝子の発現を確認する
動画の見どころ7/7枚目 7. これまでの操作を R のスクリプトで表示する.togotv#DBCLS#bioinformatics #togotv#DBCLS#bioinformatics
... データのなかから興味のある遺伝子のプロファイルを検索する方法、およびその実験データの正規化されたファイルの取得方法を紹介します。 1. NCBI GEO ...
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2018/05/09... から、自分の興味のある発現データセットや遺伝子プロファイルを検索することができるだけでなく、それらの生データを自由にダウンロードすることが ...
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2011/07/11本家はこちら http://togotv.dbcls.jp/20120128.html NCBI GEOはNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。 今回はGEOの使い方 ...
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2012/01/26... 情報のデータベースです。 今回はGEOの使い方第5弾として、GEOに登録されているマイクロアレイ実験のデータを、Rをベースに解析 ... 背景にドルからの脱却？
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2012/05/23... GEOに登録されている多くのマイクロアレイデータのなかから興味のある遺伝子のプロファイルを検索する方法、およびその実験データの正規化されたファイル ...
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2011/10/20GEOには、主にマイクロアレイ実験で得られたデータが日々蓄積されており、その登録データ数は世界最大です。それらの中から、自分の興味のある発現データ ...
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2008/12/18... 情報のデータベースです。 今回はGEOの使い方第4弾として、データセットブラウザ(Dataset browser)からダウンロードできるファイル ... データの検索や解析 ...
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2012/02/26... データを検索してその発現が特徴的な実験条件のデータを選択し、その選択したデータに関して色々な解析をデータセットブラウザで行います。データ ...
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2009/03/06公共の遺伝子発現データの検索や解析を行う. Togotv · Playlist · 8:02. Go to channel · Analyze publicly available RNA-seq data using NCBI GEO's ...
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2009/02/13... データとして、NCBI GEOより取得した公共の遺伝子発現データ（GSE1657:Adipocyte Differentiation [Homo sapiens]）を用いて、ヒトの脂肪細胞の分化 ...
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2009/09/24... から、ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) 小野 浩雅 による「遺伝子発現データ解析 ... データを解析するためのツール(NCBI GEO・GEO2R ...
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2020/12/10動画の見どころ1/5枚目 遺伝子発現データ解析 (RefEx、ChIP-Atlas、DAVID、metascape、GEO2Rなど) @ AJACSオンライン3
動画の見どころ2/5枚目 1. 個々の遺伝子の発現プロファイルを調べる〜RefEx
動画の見どころ3/5枚目 2. 数十～数千の遺伝子群の生物学的解釈〜ChIP-Atlas・DAVID・metascape・Enrichr
動画の見どころ4/5枚目 3. 公共データベース上にある遺伝子発現データを解析する〜GEO・GEO2R・GREIN・iDEP・BioJupies
動画の見どころ5/5枚目 4. 研究現場で頻繁に使われるデータベースやツールを知る〜統合TV
... 解析（DEG解析）に不可欠なツールである。原著論文で使用されたRNA-seqのデータセットは誰でも再利用できるようにGene Expression Omnibus（GEO）に ...
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2023/12/12動画の見どころ1/14枚目 RNAseqChef: 遺伝子発現変動を自動的に可視化するRNA-seq統合解析ツール
動画の見どころ2/14枚目 2. RNA-seq解析の概要
動画の見どころ3/14枚目 3. RNAseqChef の紹介
動画の見どころ4/14枚目 4. 解析例1: 二群間の比較解析(Pair-wise DEG)
動画の見どころ5/14枚目 5. Pair-wise DEG の補足
動画の見どころ6/14枚目 6. 解析例2: 複数のデータセットの統合解析(Pair-wise DEG + Venn diagram)
動画の見どころ7/14枚目 7. Venn diagramの補足
動画の見どころ8/14枚目 8. 解析例3: 時系列データの多重比較解析(Multi DEG)
動画の見どころ9/14枚目 9. 解析例4: 相関解析(Normalized count analysis)
動画の見どころ10/14枚目 10. 相関解析の補足
動画の見どころ11/14枚目 11. 解析例5: エンリッチメント解析(Enrichment viewer)
動画の見どころ12/14枚目 12. 解析例6: Public data の解析(GREINとの連携)
動画の見どころ13/14枚目 13. 補足: Public dataの解析
動画の見どころ14/14枚目 14. まとめ: RNAseqChefを使用する利点
... 解析（DEG解析）に不可欠なツールである。原著論文で使用されたRNA-seqのデータセットは誰でも再利用できるようにGene Expression Omnibus（GEO）に ...
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2023/12/12動画の見どころ1/14枚目 RNAseqChef: 遺伝子発現変動を自動的に可視化するRNA-seq統合解析ツール
動画の見どころ2/14枚目 2. RNA-seq解析の概要
動画の見どころ3/14枚目 3. RNAseqChef の紹介
動画の見どころ4/14枚目 4. 解析例1: 二群間の比較解析(Pair-wise DEG)
動画の見どころ5/14枚目 5. Pair-wise DEG の補足
動画の見どころ6/14枚目 6. 解析例2: 複数のデータセットの統合解析(Pair-wise DEG + Venn diagram)
動画の見どころ7/14枚目 7. Venn diagramの補足
動画の見どころ8/14枚目 8. 解析例3: 時系列データの多重比較解析(Multi DEG)
動画の見どころ9/14枚目 9. 解析例4: 相関解析(Normalized count analysis)
動画の見どころ10/14枚目 10. 相関解析の補足
動画の見どころ11/14枚目 11. 解析例5: エンリッチメント解析(Enrichment viewer)
動画の見どころ12/14枚目 12. 解析例6: Public data の解析(GREINとの連携)
動画の見どころ13/14枚目 13. 補足: Public dataの解析
動画の見どころ14/14枚目 14. まとめ: RNAseqChefを使用する利点