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検索結果
https://togotv.dbcls.jp/20190403.html NCBI GEO (Gene Expression Omnibus)はNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。
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2019/03/25動画の見どころ1/9枚目 1. GEOデータベースで、検索を行う
動画の見どころ2/9枚目 2. 遺伝子発現量のデータから、特定の遺伝子を検索する
動画の見どころ3/9枚目 3. 遺伝子発現量のデータを用いて、解析を行う
動画の見どころ4/9枚目 4. サンプル内容とIDの対応を調べる
動画の見どころ5/9枚目 5. 解析したデータをダウンロードする
動画の見どころ6/9枚目 6. 染色体の位置毎の遺伝子発現量を調べる
動画の見どころ7/9枚目 7. サンプルデータを使って、遺伝子発現量解析を行う
動画の見どころ8/9枚目 8. サンプルの情報の詳細を調べる
動画の見どころ9/9枚目 9. サンプル間で有意な発現差がある遺伝子を調べる.togotv#DBCLS#bioinformatics #togotv#DBCLS#bioinformatics
GEOに登録されているマイクロアレイ実験のデータを、フリーのデータ解析環境 R をベースに解析できるツール GEO2Rの使い方を紹介します。 GEO2Rを使っ ...
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2021/02/11本家はこちら http://togotv.dbcls.jp/ja/20170102.html NCBI GEO(Gene Expression Omnibus; 「ジオ」あるいは「ゲオ」と発音します)はNCBIが提供・ ...
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2017/02/24https://togotv.dbcls.jp/200126.html GREIN（GEO RNA-Seq Experiments Interactive Navigator）は、GEOに登録されているRNA-Seqデータを再利用する ...
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2020/01/23http://togotv.dbcls.jp/20180405.html NCBI GEOはNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。今回はGEOの使い方第5弾 ...
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2018/04/13動画の見どころ1/7枚目 1. GEO のトップページから口腔粘膜のトランスクリプトームを測定したデータセットを探す
動画の見どころ2/7枚目 2. 各サンプルを比較したい 2 群に分ける
動画の見どころ3/7枚目 3. データのクオリティを調べる
動画の見どころ4/7枚目 4. 2 群間で異なる発現パターンを示した遺伝子を確認する
動画の見どころ5/7枚目 5. P 値の計算方法を変更する
動画の見どころ6/7枚目 6. プローブ ID から任意の遺伝子の発現を確認する
動画の見どころ7/7枚目 7. これまでの操作を R のスクリプトで表示する.togotv#DBCLS#bioinformatics #togotv#DBCLS#bioinformatics
Comments · 遺伝子のRefSeq IDを調べ、そのmRNA、アミノ酸配列を取得する · NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているRNA-seqデータを解析する · NCBI Datasets ...
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2011/10/20... 方法、プラットフォームの登録実験数が多すぎるときの対処法などについて説明しています。 0:00 NCBI GEO を使ってRNA-seqデータ ... データを解析する @ ...
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2023/08/17高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/movie/090220DatasetBrowser_f.html NCBI GEOはNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベース ...
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2009/02/20... データを検索してその発現が特徴的な実験条件のデータを選択し、その選択したデータに関して色々な解析をデータセットブラウザで行います。データ ...
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2009/03/06本家はこちら http://togotv.dbcls.jp/20120128.html NCBI GEOはNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。 今回はGEOの使い方 ...
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2012/01/26... データベースです。 今回はGEOの使い方第5弾として、GEOに登録されているマイクロアレイ実験のデータを、Rをベースに解析できるツールGEO2Rの使い方を ...
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2012/05/23Comments · NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているRNA-seqデータを解析する · NCBI Datasetsを使ってゲノムデータを検索、閲覧、取得する · RNAseqChefを ...
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2018/05/09本家はこちら http://togotv.dbcls.jp/20110711.html NCBI GEO（Gene Expression Omnibus; 「ジオ」あるいは「ゲオ」と発音します）はNCBIが提供・ ...
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2011/07/11/20120227.html#p01 NCBI GEOはNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。 今回はGEOの使い方第4弾として、データ ... データを解析 ...
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2012/02/26... データを並列にダウンロードし、圧縮保存する方法について説明しています。 0:00 NCBI GEO ... ブラウザ上でRNA-seqデータを解析する @ AJACSオンライン14.
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2023/10/23動画の見どころ1/10枚目 NCBI GEO を使ってRNA-seqの生データおよびカウントデータを取得する
動画の見どころ2/10枚目 1. Homebrewのインストール
動画の見どころ3/10枚目 2. SRA Toolkitのインストール
動画の見どころ4/10枚目 3. Pigzのインストール
動画の見どころ5/10枚目 4. ディレクトリの作成
動画の見どころ6/10枚目 5. RNA-seqデータのダウンロード
動画の見どころ7/10枚目 6. 複数のRNA-seqデータのダウンロード
動画の見どころ8/10枚目 7. fastqファイルへの変換
動画の見どころ9/10枚目 8. 複数のファイルをfastqへの変換
動画の見どころ10/10枚目 9. pigzによるfastqファイルの圧縮
NCBI GEOの使い方1 〜マイクロアレイデータの検索・取得〜2017. TogoTV · 6:43. Arabidopsis eFP Browser でシロイヌナズナの遺伝子発現情報を見る.
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1か月前... 方法およびその生データのダウンロード方法 ... 遺伝子発現情報データベース NCBI Gene Expression Omnibus(GEO)の使い方 ... データを解析する. TogoTV•342 ...
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2008/12/18https://doi.org/10.7875/togotv.2024.025 NCBI GEO (Gene Expression Omnibus)はNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。
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1か月前動画の見どころ1/9枚目 NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているRNA-seqデータを解析する
動画の見どころ2/9枚目 1. GEO2Rについて
動画の見どころ3/9枚目 2. GEO2Rの使い方について
動画の見どころ4/9枚目 3. 解析結果の表から処理区ごとの遺伝子発現パターンを確認する
動画の見どころ5/9枚目 4. カラムの追加および解析結果のダウンロード方法について
動画の見どころ6/9枚目 5. 解析結果の図表から処理区ごとの遺伝子発現パターンを確認する
動画の見どころ7/9枚目 6. 解析手法の詳細な設定変更について
動画の見どころ8/9枚目 7. Profile graphを利用して特定の遺伝子発現プロファイルを確認する
動画の見どころ9/9枚目 8. 解析で利用したR scriptを確認する
本家はこちら http://togotv.dbcls.jp/20100326.html#p01 NCBI GEO(Gene Expression Omnibus)は、遺伝子発現バンクとして、主にマイクロアレイデータ ...
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2011/09/28... Function. Doc Snipes•54K views · 6:53. Go to channel · Reactome を使ってパスウェイ情報を検索する〜解析データのマッピング〜. TogoTV•404 views.
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2008/03/23