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... Protein Data Bank、分子ビューアMolmil、相同複合体の検索・モデリングサーバHOMCOSの使い方について紹介しています。またAlphaFold2による予測 ...
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PDBjを使ってタンパク質の立体構造データを見る @ AJACSオンライン10
1-1. PDBの収納情報について
1-2. PDBのファイルフォーマットについて
1-3. PDBデータの検索方法
2. 分子ビューアの使い方-MolMilを中心として
3. アミノ酸配列からの3Dモデリング
3-1. HOMCOSサーバを用いたホモロジーモデリング
3-2. AlphaFold2による予測について
... 検索語にして 得られる結果から絞り込みを行い、最終的に、ヒトのアミノ酸配列を取得する方法を紹介します。 #togotv#DBCLS#bioinformatics #togotv ...
... ホモロジー・モデリングによる立体構造予測が有用です。AlphaFoldを用いる場合は数時間計算時間がかかることがあります(参考: Google Colab版公式の ...
HOMCOS(HOMology modeling of Complex Structure) を使って構造未知の分子ペアの構造を予測する
1. HOMCOSについての説明
2. 「ホモ多量体のモデリング」で立体構造予測を行う
3. 「ホモ多量体のモデリング」の出力結果について
4. 「化合物-タンパク質複合体のモデリング」で立体構造予測を行う
5. 「化合物-タンパク質複合体のモデリング」の出力結果について