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#カガク。#生体分子。#分子。#光合成。鍵と鍵穴。グラデーション。豊橋技術科学大学「光合成を調節する光スイッチの動作するしくみを解明」よりフィコシアノビリン(phycocyanobilin)が結合したシアノバクテリオクロムRcaEの構造PDB 8K9OとそのPDBsumデータ。Jmol ecosci.jp/s/bm_m_ps.html pic.twitter.com/hlfiTBD5aK
#カガク。#生体分子。#分子。#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"。Nature v630 n8016のCover Storyページ内容を画像で。例示タンパク質はPDB 7PNM。 natureasia.com/ja-jp/nature/h… pic.twitter.com/iXjxSM2snj
#カガク。#生体分子。#分子。#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"です! Nature Volume 630 Number 8016 natureasia.com/ja-jp/nature/6… 「Cover Story: 複合体の構造予測:AlphaFold3でタンパク質と分子の相互作用の予測が可能に」
#カガク。#生体分子。#分子。Nature ハイライト「構造生物学:コリンおよびエタノールアミン輸送体の輸送機構」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8QCS・8QCT・8QCX・8QCY・8QD0・8R8T。
#カガク。#医。#がん。#生体分子。#分子。#医薬。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開のPDBデータ294件の中から8YKIのA鎖(cif→pdb変換)とそのPDBsumデータ,タスルグラチニブが結合した線維芽細胞増殖因子受容体1(FGFR1)。JmolトピックNo.561に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/9Fq7z2F5EM
#カガク。#生体分子。#分子。#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"。AlphaFold3構造計算例,リガンド(現在ヘムやATPなど一部のみ)結合データ例としてヘモグロビン構造PDB 2HHBを例に。Jmol ecosci.jp/AF/#AF3 pic.twitter.com/My8Dxa259A
#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。HIV/エイズ。HIVインテグラーゼ阻害剤ドルテグラビル(dolutegravir)が発明協会 恩賜発明賞受賞。同分子が結合したプロトタイプフォーミーウイルス(PFV)のインテグラーゼとDNAの構造PDB 3S3Mほか。JmolトピックNo.613に加筆。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/uDBcrENtv7
#カガク。#生体分子。#AI。AlphaFold3(AlphaFold 3)関連情報の置き場所変更。その後も続々記事。スペースが入ったり入らなかったりするのでGoogleで両方ニュース検索できるリンクも追加。 ecosci.jp/AF/#AF3 pic.twitter.com/m0jGXEa7Xu
#カガク。#生体分子。#分子。GPCR。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。一昨日公開のPDBデータ290件の中から8YUT(他に8YUU・8YUV公開)のR鎖とそのPDBsumデータ,アゴニストのアンタミン(amthamine)結合のヒスタミンH2受容体。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ このページでH2Rは初。 pic.twitter.com/MvBzGBlp40
#カガク。#生体分子。#分子。Nature ハイライト「構造生物学:ノルアドレナリン輸送体のクライオ電子顕微鏡構造」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8Y94・8YR2・8Y95・8Y92・8Y8Z・8Y93・8Y90・8Y91。 8YR2のA鎖を拙サイト既報,ニソキセチンが結合。JmolトピックNo.1232 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/n3V0Yd7zSl
#カガク。#生体分子。#分子。Nature ハイライト「微生物学:地球の窒素循環に重要なアーキアが持つアンモニア濃縮装置」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8C8L・8C8K・8C8M・8C8N・8C8O・8C8R。
#カガク。#生体分子。Nature ハイライト「構造生物学:ヒトγδ TCR–CD3複合体の構造」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8JC0・8YC0・8WYI・8WY0・8JCB・8JBV。
#カガク。#生体分子。#感染。グラデーション。PDBj「今月の分子 294:インジェクティソーム(Injectisome)」よりサルモネラ菌のインジェクティソーム(injectisome)PDB 7AH9の1A・1F・1G・1K・1Z・2J・5P・6A・7B鎖,cif→pdb変換したデータ。JmolトピックNo.1235 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/jjbPa96PYb
#カガク。#生体分子。#脳。#アルツハイマー。#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"。グラデーション。東京都医学総合研究所「VCPのD395G変異で発症した空胞型タウオパチーのタウ線維は…」よりPDB 9EROのA-J鎖(他に9ERM・9ERN公開),空胞型タウオパチー。AlphaFold3構造も取得。 ecosci.jp/chem5/alzheime… pic.twitter.com/jPPPrOlGyb
#カガク。#生体分子。#分子。GPCR。Nature ハイライト「構造生物学:GPCR活性化の時分割クライオ電子顕微鏡法による追跡」のPDBデータから8GGFのR鎖とそのPDBsumデータ,β2アドレナリン受容体(β2AR)。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/H5zLXCXkrV
#カガク。#生体分子。#分子。#AI。AlphaFold2。本日2件目のGPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。本日公開のPDB 8UWL(他に8V6U公開)のA鎖とそのPDBsumデータ,リスリド(lisuride)が結合した5-HT2A受容体。ピンク優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/rEfbmK6ey7
#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。膜タンパク質。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開のPDBデータ359件の中から8YR2のA鎖とそのPDBsumデータ,ニソキセチン(nisoxetine)が結合したノルアドレナリントランスポーター。緑やや優勢。JmolトピックNo.1232 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/q1BjE1rHGn
#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。GPCR。μオピオイド受容体。理研「アロステリック調節薬が構造平衡を変えて効く仕組み」のPDBデータ8K9L・8K9Kが本日公開。前者のR・S鎖とそのPDBsumデータを掲載。完全作動薬DAMGOとアロステリック調節薬BMS-986122が結合。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/Hio2MUPbrn
【新刊案内】 『皮膚ガスのはなし ―体臭は心と体のメッセージ―』2024/5/28発売 体臭の原因となる「皮膚ガス」の基礎知識から体臭別の原因物質・対策まで,わかりやすく解説。 asakura.co.jp/detail.php?boo…
プレスリリースPDFに“続いて,Toll-like receptor(TLR)4 を発現させた HEK293 細胞に EM982 と LPS を混合添加して培養し…”。#生体分子。#分子。TLR4構造例。Jmol ecosci.jp/tlr/#tlr4 pic.twitter.com/rpWMrpsk0U
#カガク。#医。#脳。#生体分子。#分子。#分子。#糖鎖。鍵と鍵穴。グラデーション。生理学研究所「抗インフルエンザ薬を脳梗塞の再生医療に」でニュース多数。ザナミビル(zanamivir)と同分子結合PDBデータ例1A4GのA鎖とそのPDBsumデータ。ピンク優勢。JmolトピックNo.1231 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/SToxtBaaT5
#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。ダニ媒介感染症SFTS治療薬候補「アビガン」のニュース多数。抗インフルエンザ薬アビガン(Avigan)は商品名で,一般名はファビピラビル(favipiravir,T-705)。JmolトピックNo.620に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/fMkVHT7k89
#カガク。#植物。#生体分子。#分子。L-2-アミノピメリン酸(L-2-aminopimelic acid)。JmolトピックNo.1230 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/FneI0xp8T9
5(こ)、(ま)2(つ)、7(な)の語呂合わせで今日は #小松菜の日。植物の生育を助ける「バイオスティミュラント」の一つとして、理研の研究チームが同定したアミノ酸。小松菜を使った添加実験でその機能を確かめたところ、収穫がなんと1.7倍になりました。 #科学道 📽️youtu.be/CBxztbXpgdw
#カガク。#環境。#分子。#生体分子。PFAS汚染問題。鍵と鍵穴。グラデーション。PFOAが結合したヒトの心臓由来脂肪酸結合タンパク質PDB 7FEK(論文未出)とそのPDBsumデータ追加。本日入手の新刊2冊ほかへのリンクも追加。Jmol PFAS ecosci.jp/PFAS/ pic.twitter.com/ymjuRWrOC6
#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。抗インフルエンザ薬アビガン(Avigan)は商品名で,一般名はファビピラビル(favipiravir,T-705;インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼ阻害剤)。JmolトピックNo.620 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/4wt8nuRehG
アビガン錠(ファビピラビル)の効能・効果に「重症熱性血小板減少症候群(SFTS)ウイルス感染症」を追加することが承認了承されていました! 世界初・国内初のSFTSウイルス治療薬です!😊 インフルエンザ治療薬として承認されたものの日の目を見ないままでしたが、ついに…!
#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。鍵と鍵穴。グラデーション。NHK「マダニ媒介感染症 SFTS治療薬に「アビガン」正式承認の見通し」の抗インフルエンザ薬アビガン(Avigan)は商品名で,一般名はファビピラビル(favipiravir,T-705)。JmolトピックNo.620に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/Hmtm2LDMR0
#カガク。#植物。#生体分子。#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。理研「植物の発根を促進する新規機能性アミノ酸を同定」(YouTube動画あり)のL-2-アミノピメリン酸(L-2-aminopimelic acid)と参考データの同分子結合PDBデータ例5E3RとそのPDBsumデータ。JmolトピックNo.1230 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/votwvragkh
#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。GPCR。理研「アロステリック調節薬が構造平衡を変えて効く仕組み」のYouTube動画公開。GPCR関連ニュースに掲載。 ecosci.jp/GPCR/news.html 未公開PDBデータ8K9L・8K9K。 pic.twitter.com/Ep6FTw8ApJ
#カガク。#生体分子。#分子。メガリン(megalin)。PNAS“Cryo-EM structures elucidate the multiligand receptor nature of megalin” pnas.org/doi/10.1073/pn… 未公開PDBデータ8JUT・8JUU・8JX8~8JXJ。
#カガク。#生体分子。#分子。GPCR。代謝型グルタミン酸受容体5(mGlu5)。Nature ハイライト「構造生物学:代謝型グルタミン酸受容体の段階的活性化」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… 既報PDBデータ8T7H・8T8M・8TAO・8T6Jの論文。