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TPMのファイルは遺伝子がEnsembleのTranscript ID + versionの形式になっていて、そのままだとオンラインツール(BioMart)での遺伝子名への変換がうまくできなかったので、ver.を削ってから変換し、適当なカットオフで取った遺伝子リストでGO termに進んだ。

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ぽす毒☠️@vetpostdoc

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結果、 症例データと同じパスウェイが挙がってきて今とても幸せな気持ちで眺めている。 コーディングとか全くできないぽす毒でも、なんとか自力で解析できたってことでいいのかな… もちろん論文やグラント申請時は専門家に依頼するけど。 お付き合いありがとうございやした!

ぽす毒☠️@vetpostdoc

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