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#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。神経障害性疼痛治療薬などとしてMIPS521に注目。GPCR関連ニュース ecosci.jp/GPCR/news.html… pic.x.com/WcrcDaYXRC
#カガク。#生物。#生体分子。#分子。#感覚。鍵と鍵穴。グラデーション。一昨日公開のPDB 9E6D(他に9E6B・9E6C公開)のA鎖とPDBsumデータ,ルミクローム(ルミクロム,lumichrome)が結合したタコの化学触覚受容体CRT1。緑一色。JmolトピックNo.745に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… オクトパスです。 pic.x.com/JMX7jvyaoO
#カガク。#医。#がん。#生体分子。#分子。#医薬。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開のPDBデータ316件の中から9IOVのE-H・Q-T鎖とPDBsumデータ,ゴシポール(gossypol)が結合したヒトの乳酸脱水素酵素A。ピンクやや優勢。JmolトピックNo.961に追記。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/WUb18OWA1P
#カガク。#医。#生体分子。#分子。#感染。#SFTS。注意喚起。マダニ媒介SFTSのニュースが増えています。JmolトピックNo.620に記事追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.x.com/sKQijkGYP4
#カガク。#医。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)。鍵と鍵穴。グラデーション。SARS-CoV-2の3CLプロテアーゼ阻害剤S-892216および同分子結合PDB 9LVV(他に9LVR・9LVTあり)とPDBsumデータ。緑・ピンク拮抗。Jmol ecosci.jp/COVID-19/ pic.x.com/X50dZWHizJ
#カガク。#生体分子。#分子。#書籍。“元素・分子が登場する本を読もう!”ページに載せる以外の本をまとめて紹介するページを公開! まだ1冊だけで,作り始めですが。Jmol“元素・分子が登場する本たち!” ecosci.jp/scibook/sciboo… pic.x.com/AwcMloMHrs
#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。#新刊。鍵と鍵穴。グラデーション。インフルエンザ薬ペラミビル(peramivir)登場小説お勧めで画像追加。Jmolインフルエンザ情報 ecosci.jp/chem10/weekmol… それにしても大変なリンク集を作ったものだ。“元素・分子が登場する本を読もう!” pic.x.com/5ijoylFEse
#カガク。#生体分子。KEK「小型酵素が持つ“二刀流”の進化戦略」のPDBデータ8KD9(2024/08/14公開,8KDAも参照可)。JmolトピックNo.1318 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/xuuQkBRK73
#カガク。#生体分子。KEK「小型酵素が持つ“二刀流”の進化戦略 12個の小型酵素が星型を形成し、tRNA前駆体を正確に前後から切断」 kek.jp/ja/press/20250… 2024/08/14公開PDBデータ8KD9・8KDA。
#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。#結核。鍵と鍵穴。グラデーション。GSK1570606Aが結合した結核菌のCTPシンターゼPDB 8UV9(一昨日公開,他に8UV4・8UV8・8UVAあり)のA鎖とPDBsumデータ。緑優勢。JmolトピックNo.709に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.x.com/JcrrHcZ53C
#カガク。#生体分子。#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。アレー!! なアレーン類データ追加。スルファト-テルフェン[3]アレーンが結合したフコース結合レクチンタンパク質PDB 9I1O(昨日公開)とPDBsumデータ。緑優勢。JmolトピックNo.811に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.x.com/KBtOGpqcqh
#カガク。#生体分子。アレスチン集合体。Nature ハイライト「構造生物学:多様なGPCRキナーゼによるリン酸化が指示するアレスチン集合」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8TIL・8TIN・8TII・8TIO。
#カガク。#生体分子。#分子。Nature ハイライト「細胞生物学:実験的架橋とコンピューター解析でエンドソームの構造インタラクトームを解明」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… 引用PDBデータ6WM2・7BL1・7UXH・7U4Tほか。
#カガク。#生物。#生体分子。Nature Volume 643 Number 8070 natureasia.com/ja-jp/nature/6… 「Cover Story: 奇妙な花:ゲノム解析がイヌバラの生殖の謎を解明」
#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。PDBj「今月の分子 307: βラクタマーゼの活動をとらえる」よりセフトリアキソン(ceftriaxone)とその分解構造例が結合したβ-ラクタマーゼPDB 6B68のB鎖とPDBsumデータ。ピンク優勢。JmolトピックNo.1317 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/F41g2oCXdJ
#カガク。#生体分子。#分子。GPCR。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開のPDBデータ,非GPCRのあとはGPCRの9M4T(他に9M4Qあり)とPDBsumデータ,選択的アゴニストのシロドシン(silodosin)結合のα1Aアドレナリン受容体(α1AAR)。緑優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/QXVm3I9glk
#カガク。#生体分子。#分子。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。非GPCR。本日公開のPDBデータ277件の中から9J7WのA鎖とPDBsumデータ,東京大学「藍色光を選択的に吸収するチャネルロドプシンKnChRの構造と機能を解明」より。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/q3doYbPuCx
結核の最近の記事追加で再投。#カガク。#医。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。結核治療薬リード化合物候補JNJ-6640紹介。JmolトピックNo.709 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.x.com/WzFPdbyali
#カガク。#生体分子。#分子。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。東京大学「ヒスタミン受容体のGタンパク質選択性の分子機構を解明」のPDB 9LRE(他に9LRC・9LRD・9LRBあり)のR鎖とPDBsumデータ。濡木 理さんほかの研究グループによる。緑優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/Y8JHJRBzaT
#カガク。#医。#生体分子。GPCR。東京大学「副甲状腺ホルモン1型受容体のGタンパク質選択機構を解明」 s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/10835/ “副甲状腺ホルモン1型受容体 (PTH1R)”,“本研究の成果…骨粗鬆症治療薬の設計につながる…”。濡木 理さんらの研究グループによる。PDBデータ9JR2・9JR3(こちらに糖鎖)。
#カガク。#生体分子。#近刊。今夏発刊予定の細胞の分子生物学 原書第7版(メディカル・サイエンス・インターナショナル)、表紙は膜タンパク質! 特徴や目次PDF公開、第7版もJmolトピックで検索を!! ecosci.jp/chem13/topics1… pic.x.com/FbXwV3RLdl
#カガク。#医。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。#元素。2019年承認のプレトマニド(pretomanid)とリード化合物候補 JNJ-6640をJmolトピックNo.709に追記。画像の3分子ともフッ素が入っていますね。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.x.com/t4iybb04Br
#カガク。#生体分子。#分子。GPCR。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。続いて本日公開のPDB 9CM7のR鎖とPDBsumデータ,アゴニストTUG-1375と活性化因子AZ-1729が結合した遊離脂肪酸受容体2(FFA2)。どちらも緑優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/KkNUIOeFSU
#カガク。#生体分子。#分子。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開のPDBデータ258件の中から9KOYのA鎖とPDBsumデータ,イネ用除草剤イプトリアゾピリド(iptriazopyrid)結合の4-ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)。JmolトピックNo.1316 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/jth26BDMm6
#カガク。#医。#生体分子。#分子。#医薬。#アルツハイマー。#iPS。鍵と鍵穴。グラデーション。京都大学 iPS細胞研究所「家族性アルツハイマー病患者さんを対象とした企業治験を開始」のブロモクリプチン(bromocriptine)。JmolトピックNo.785に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.x.com/yQtoWsvT8d
#カガク。#ツタエル。#分子。#生体分子。来月末でecosci.jpは29歳,この1年間もいろいろなニュースがありました。中でも化学同人『化学』休刊は本当に残念です。 ecosci.jp/inet/heya_hist… pic.x.com/eJn0vbx1ff
#カガク。#生体分子。#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。気になるACS Bio & Med Chem Au誌の記事,PDB 9QAMは未出だが先行してリガンドのシプロフロキサシン(ciprofloxacin)および同分子結合別データ8GJLとPDBsumデータ,緑一色。。JmolトピックNo.1315 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/P0CEF3ZDdZ
#カガク。#生体分子。#分子。#量子力学100年。ecosci.jpは来年で30歳。雑誌特集『量子科学技術の現在地』(「現代化学」2025年7月号)。JmolトピックNo.1314 ecosci.jp/chem13/topics2… 特集以外のデータも掲載。“元素・分子が登場する本を読もう!” pic.x.com/Y91ZZb0NmB
#カガク。#星屑。#生体分子。#分子。#元素。『量子コンピュータと量子化学計算』p.31にFeMoコファクター結合ニトロゲナーゼPDB 3U7Q。Jmol鉄硫黄クラスターを含む生体分子のSITE例 ecosci.jp/s/bm_m_SF4.html pic.x.com/3fuwJ5awfc
#カガク。#量子。#量子力学100年。#新刊。「現代化学」7月号(≪特集≫量子科学技術の現在地)届く。tkd-pbl.com/book/b10136118… 『量子コンピュータと量子化学計算』,『量子化学計算を用いた創薬研究』など。#生体分子。#分子。#医薬。鍵と鍵穴。 pic.x.com/FCj8QC28fg
#カガク。#生体分子。#分子。#元素。鍵と鍵穴。グラデーション。Nature ハイライト「構造生物学:メチル補酵素M還元酵素(MCR)活性化複合体…」のPDBデータ9H1L(A・C・D・F鎖とG・H・I鎖)とPDBsumデータ(factor 430と[8Fe-9S-C] クラスター)。JmolトピックNo.515に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.x.com/WcTFkHq1Az
#カガク。#生体分子。#分子。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開のPDB 9DKC(他に9DK9・9DKA・9DKB公開)とPDBsumデータ,阻害剤TD-3が結合した尿酸トランスポーターURAT1。緑優勢。JmolトピックNo.1251に追記。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/fnTrWJIh08