#カガク。#生体分子。#分子。#アミノ酸。必須・非必須アミノ酸。細胞内・細胞外。“細胞外タンパク質仮説”。 x.com/esumi_uoeh/sta…

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。膜タンパク質。筋萎縮性側索硬化症（ALS）。鍵と鍵穴。グラデーション。昨日公開のPDB 8S6JとPDBsumデータ，リルゾール（riluzole；ALS治療薬）が結合した電位依存性ナトリウムチャネルNavMs。論文未出。JmolトピックNo.1087に追記。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/kbdu65aeaw

#カガク。#生体分子。#分子。#アミノ酸。必須・非必須アミノ酸。細胞内・細胞外。 x.com/esumi_uoeh/sta…

#カガク。#生体分子。#プロテオーム。Nature ハイライト「生化学：NACが新生ポリペプチド鎖のN末端修飾の指揮を執る」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ9F1B・9F1C・9F1D。

#カガク。#生体分子。#糖鎖。#感染。Nature ハイライト「構造生物学：C型肝炎ウイルスE1/E2タンパク質のクライオ電子顕微鏡構造」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8RJJ・8RK0。

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。GPCR。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。昨日公開のPDB 9F33（他に9F34公開）のR鎖とPDBsumデータ，アゴニストFOB02-04Aが結合したドーパミン（ドパミン）D3受容体。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/0z8u8rckpi

#カガク。#生体分子。#分子。#アミノ酸。必須・非必須アミノ酸 x.com/esumi_uoeh/sta…

#カガク。#ノーベル賞。今年もケムステさんの大胆予測！ 分野別に候補者・テーマ列挙。“タンパク質構造解析AI・AlphaFold の開発”も。#AI。#生体分子。 x.com/chemstation/st…

#カガク。#生体分子。#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。本日公開のPDBデータ228件の中から8ZYQのB鎖とPDBsumデータ，ピモジド（pimozide）が結合したヒトの電位依存性カリウムチャネルhERG（Kv11.1）。論文未出。日本の研究グループによる。JmolトピックNo.1203に追記。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/tni5fva38f

#カガク。#生体分子。#分子。#アミノ酸。ヘモグロビン。水溶性タンパク質。必須・準必須・非必須アミノ酸区別のこだわり。多くの生物のアミノ酸配列の違いから #分子進化 も視野に。Jmolヘモグロビン ecosci.jp/pdb/hemoglobin… pic.x.com/fczhsjpnrs

#カガク。#生体分子。#分子。膜タンパク質。VMAT2。未公開PDBデータ8WRD・8WRE・8WVG。 x.com/IPR_pr/status/…

#カガク。#生体分子。#分子。#アミノ酸。FASTA形式アミノ酸配列から、ヒトの必須・準必須・非必須アミノ酸の区別着色用秀丸マクロをそれぞれの数を算出するように改良。マクロはテキスト形式なのでご自分で変更も可能です。　ecosci.jp/pdb/hm/macro_g… pic.x.com/ftl4v41mn9

#カガク。#生体分子。#アミノ酸。名古屋大学『細菌の「べん毛」を動かす"回転モーター"の構造を解明』の海洋性ビブリオ属細菌のべん毛のSリングの構造PDB 8Z4D（他α炭素のみ；8Z4Gにあり）。アニメgifに必須・準必須・非必須アミノ酸区別画像も含む。JmolトピックNo.1246 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/zmixyiblt6

#カガク。#生体分子。#分子。#アミノ酸。必須・準必須・非必須アミノ酸区別のこだわり続く。#生命誕生 にも繋がるセントラルドグマ関連。Jmolコドンと遺伝暗号表 ecosci.jp/pdb/codon_j.ht… pic.x.com/fioaikmo3b

#カガク。#細胞。#生体分子。#分子。#アミノ酸。引き続き必須・準必須・非必須アミノ酸の区別にこだわって。細胞接着に関わるカドヘリンについて。Jmolカドヘリン ecosci.jp/chem10/weekmol… pic.x.com/aonbi8uddt

#カガク。#生体分子。#分子。#アミノ酸。GPCR。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。アミノ酸の色分けにヒトの必須・準必須・非必須の区別追加。例として9/11公開のPDB 8Y53のR鎖とPDBsumデータ，アゴニストMK-5046結合ボンベシン受容体サブタイプ3（BRS3）。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/rn4596jkaa

#カガク。#生体分子。#分子。#アミノ酸。恐るべしGoogle！ 私的事情で書き直したコラーゲンのアミノ酸配列テキストがしっかり見つかってる。諸事情でアミノ酸識別の見直しが必要で，自作秀丸マクロも新作必要。 pic.x.com/jynwzja1a2

#カガク。#生体分子。岩田 想さん。“受賞テーマ：医学・薬学に資する膜蛋白質の三次元構造ならびに時間分解を加えた四次元構造解析の研究”。 x.com/matsubara_m/st…

#カガク。#生命誕生。#生体分子。GADV仮説！　ecosci.jp/pdb/codon_j.ht… pic.x.com/iuixrtihmb x.com/nori_ichihashi…

#カガク。#生体分子。#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。Nature ハイライト「構造生物学：ノルエピネフリン輸送体の構造から…」のPDB 8XB2とPDBsumデータ，阻害剤ラダファキシン（radafaxine）が結合したノルアドレナリントランスポーター。JmolトピックNo.1232に追記。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/lwxd3zqlia

#カガク。#生体分子。#分子。膜タンパク質。Nature ハイライト「構造生物学：ノルエピネフリン輸送体の構造から得られた作用機構の手掛かり」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8XB4・8XB3・8XB2。他に引用あり。

#カガク。#生体分子。CRISPR。Nature ハイライト「Cas14の活性と構造」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8Z4L・8Z4J・8YHD・8YHE・8Z99・8Z9C・8Z9E。

#カガク。#ヒト。#生体分子。#分子。Nature ハイライト「構造生物学：シャペロニン複合体によるタンパク質のin situ折りたたみを見る」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8P4M・8P4N・8P4O・8QXS・8QXT・8P4R・8QXU・8QXV・8P4P。他に引用あり。

#カガク。#ヒト。#生体分子。Nature Volume 633 Number 8029 natureasia.com/ja-jp/nature/6… 「Cover Story: 島の歴史：ゲノム解析からラパ・ヌイの集団史が明らかに」

#カガク。#生体分子。#分子。GPCR。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開のPDB 9D3G（他に9D3E公開）のA鎖とPDBsumデータ，アロステリックアゴニストOXM1結合のCCR6。緑優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/lcqjblacei

#カガク。#生体分子。#アルツハイマー。本日公開のPDBデータ360件の中から8J47，アミロイドβ線維E22G変異体（残基番号12-40）。理研「家族性アルツハイマー病に生じる特異な老人斑の謎に迫る」より。Jmolアルツハイマー病治療薬 ecosci.jp/chem5/alzheime… pic.x.com/d0ai6m226n

#カガク。#生体分子。明日は水曜、どんな新規PDBデータが公開されるだろうかと前日はワクワクする。昨夜の畏友との久々の再会同様、ヒトはそれぞれの歴史を背負いながら多くの交点を経て成長していくのだと思う。 pic.x.com/yiiudtoi8x

#カガク。#生体分子。#痒み。 ※参考:アトピー性皮膚炎痒み関連Jmolトピック例　ecosci.jp/chem13/topics2… x.com/ky0sugar/statu…

#カガク。#生体分子。PDBデータ8Z4D ・8Z4G。 x.com/megane_de_nopp…

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。鍵と鍵穴。グラデーション。PNASにケタミンの記事（Science記事紹介），S-ケタミン（S-ketamine）とR-ケタミン（R-ketamine）の図をJmolトピックNo.472に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.x.com/egsl0ebs4y

#カガク。#生体分子。#分子。アミノ酸。 x.com/esumi_uoeh/sta…

#カガク。#環境。#生体分子。#分子。#医薬。鍵と鍵穴。グラデーション。北海道大学「3種類の睡眠薬の定量法を構築…」論文のラメルテオン（ramelteon）・スボレキサント（suvorexant）と関連PDBデータを既出レンボレキサント（lemborexant）のJmolトピックNo.959に追記。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.x.com/2g0v6kdjdp

#カガク。#高分子。#生体分子。“本菌が有するセルロースを酸化的に低分子化する酵素(溶解性多糖モノオキシゲナーゼ)のうちの1つに、未知のドメインが付加していることが明らかとなりました”。 x.com/utokyo_news/st…

#カガク。#生体分子。Nature ハイライト「生化学：ユビキチン化過程でUbが酵素から酵素へと受け渡される仕組み」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ9B55～9B5X。

#カガク。#生体分子。「生物物理学：リボソームによるタンパク質折りたたみの影響」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… 引用PDBデータ4YBB・6PJ6・6XZ7・7K00・7LVK・7N1P・7O1A・7PJS・7Z20・7ZP8・1QFH・1TIT・4Q21。

#カガク。#生体分子。#分子。先ほどの非GPCRのGtCCR4構造が日経ニュースに。日経「東大・名工大、非古典的チャネルロドプシンGtCCR4の高感度光受容機構を解明」 nikkei.com/article/DGXZRS… ※Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/j0ghodxmyx

#カガク。#生体分子。#分子。#薬物。続いてはGPCR。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開のPDB 8jxrのA鎖とPDBsumデータ，LSDが結合したドーパミン（ドパミン）D1受容体。緑優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/mlvgls6hfp

#カガク。#生体分子。#分子。非GPCR。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開のPDBデータ375件の中から8YELとそのPDBsumデータ，レチナール結合のチャネルロドプシンGtCCR4。東京大学の濡木 理さんほかの研究グループによる。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/fwiprrqb8i

#カガク。#生体分子。#分子。#嗅覚。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。N,N-ジメチルシクロヘキシルアミン（DMCHA）が結合した微量アミン関連受容体7f（TAAR7f）PDB 8PM2のR鎖とPDBsumデータ。緑優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.x.com/wnd9b1rrcu