#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。ダニ媒介感染症SFTS治療薬候補「アビガン」のニュース多数。抗インフルエンザ薬アビガン（Avigan）は商品名で，一般名はファビピラビル（favipiravir，T-705）。JmolトピックNo.620に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/fMkVHT7k89

#カガク。#植物。#生体分子。#分子。L-2-アミノピメリン酸（L-2-aminopimelic acid）。JmolトピックNo.1230 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/FneI0xp8T9

#カガク。#環境。#分子。#生体分子。PFAS汚染問題。鍵と鍵穴。グラデーション。PFOAが結合したヒトの心臓由来脂肪酸結合タンパク質PDB 7FEK（論文未出）とそのPDBsumデータ追加。本日入手の新刊2冊ほかへのリンクも追加。Jmol PFAS ecosci.jp/PFAS/ pic.twitter.com/ymjuRWrOC6

#環境。#分子。#生体分子。PFAS汚染問題。PFOA結合PDBデータ（論文未出）が1件増えていたので拙ページに追加しなくては。本日PFAS本1 冊到着予定。#新刊。#近刊。 pic.twitter.com/8JK8mk3L2K

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。抗インフルエンザ薬アビガン（Avigan）は商品名で，一般名はファビピラビル（favipiravir，T-705；インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼ阻害剤）。JmolトピックNo.620 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/4wt8nuRehG

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。#感染。鍵と鍵穴。グラデーション。NHK「マダニ媒介感染症 SFTS治療薬に「アビガン」正式承認の見通し」の抗インフルエンザ薬アビガン（Avigan）は商品名で，一般名はファビピラビル（favipiravir，T-705）。JmolトピックNo.620に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/Hmtm2LDMR0

#カガク。#植物。#生体分子。#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。理研「植物の発根を促進する新規機能性アミノ酸を同定」（YouTube動画あり）のL-2-アミノピメリン酸（L-2-aminopimelic acid）と参考データの同分子結合PDBデータ例5E3RとそのPDBsumデータ。JmolトピックNo.1230 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/votwvragkh

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。GPCR。理研「アロステリック調節薬が構造平衡を変えて効く仕組み」のYouTube動画公開。GPCR関連ニュースに掲載。 ecosci.jp/GPCR/news.html 未公開PDBデータ8K9L・8K9K。 pic.twitter.com/Ep6FTw8ApJ

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。未公開PDBデータ8Y94・8YR2・8Y95・8Y92・8Y8Z・8Y93・8Y90・8Y91。

#カガク。#生体分子。#分子。メガリン（megalin）。PNAS“Cryo-EM structures elucidate the multiligand receptor nature of megalin” pnas.org/doi/10.1073/pn… 未公開PDBデータ8JUT・8JUU・8JX8～8JXJ。

#カガク。#生体分子。#分子。GPCR。代謝型グルタミン酸受容体5（mGlu5）。Nature ハイライト「構造生物学：代謝型グルタミン酸受容体の段階的活性化」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… 既報PDBデータ8T7H・8T8M・8TAO・8T6Jの論文。

#カガク。#医。#生体分子。#分子。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。本日公開のPDB 8JPN（他に8JPP公開）のR鎖とそのPDBsumデータ，アゴニストのcis-エポキシコハク酸が結合したコハク酸受容体1（SUCR1）。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ 8JPNってJPNが入ってる。 pic.twitter.com/vRbpTlH7RQ

#カガク。#生体分子。#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。本日公開のPDBデータ244件の中から8XCM（他に8K6J・8K6K・8XCN公開）のA鎖とPDBsumデータ，FADと鉄硫黄クラスターが結合したフルクトースデヒドロゲナーゼ。京都大学の研究。JmolトピックNo.641に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/MVlsSjFKjI

#カガク。#医。#感染。#生体分子。#分子。#医薬。京都工芸繊維大学「分子化学系 北所健悟 准教授らの研究グループは、パセリ油の不飽和脂肪酸が黄色ブドウ球菌の病原因子を阻害するメカニズムを解明しました」 kit.ac.jp/2024/05/news24… 未公開PDBデータ8K7P・8K7Q・8YIB。

#カガク。#生体分子。#聴覚。#AI。クラスC GPCR。GPR156。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。先ほどのScience Portal KoreaプレスリリースよりPDB 8IEI（cif→pdb変換）のA鎖とそのPDBsumデータ，リン脂質のligand A1LYAが結合したGPR156。緑優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/IgF8rWDUh5

#カガク。#生体分子。#分子。#AI。AlphaFold2！。GPCR。5-HT2AR。鍵と鍵穴。グラデーション。話題のScience論文関連情報をAlphaFold構造ページにも追記。 ecosci.jp/AF/#AF2_240516 pic.twitter.com/BZE5LXAFNZ

#カガク。#生体分子。#聴覚。#AI。GPCR。Science Portal Korea「聴覚機能における特定の受容体タンパク質の働きを解明 韓国」spap.jst.go.jp/korea/news/240… PDBデータ8IED・8IEB・8IEC・8IEQ・8IEI・8IEP（他に引用あり），AlphaFold2構造（コードma-1015e）も参照可能。

#カガク。#生体分子。#分子。#AI。AlphaFold2！。GPCR。5-HT2AR。鍵と鍵穴。グラデーション。話題のScience論文（未公開PDBデータ8V6U・8UWL，他に7RAN・7WC7・6A93・6A94引用）関連情報をGPCR関連ニュースにまとめる。 ecosci.jp/GPCR/news.html… pic.twitter.com/UGqZ5W6ndW

#カガク。#生体分子。#分子。#AI。AlphaFold2！。GPCR。5-HT2AR。鍵と鍵穴。話題の論文。Science“AlphaFold2 structures guide prospective ligand discovery” science.org/doi/10.1126/sc… 有料だが図のPDFダウンロード可能。未公開PDBデータ8V6U・8UWL，他に7RAN・7WC7・6A93・6A94引用。

#カガク。#医。#感染。#分子。#医薬。#生体分子。ニュース多数の溶連菌・人食いバクテリア関連研究。治療薬候補のMn007（Mannan-007）と参考PDBデータ2XH3（DNase）のA鎖。JmolトピックNo.1229 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/jOj1Uicus6

#カガク。#生命。#生物。#岩石。#分子。#生体分子。#物化生地。“蛇紋岩”。第100回サイエンスカフェにいがた『科学書を翻訳するという仕事』 ecosci.jp/n-cafe/yokoku1… ゲスト斉藤隆央さんの訳書「生命、エネルギー、進化」p.122，128，138，170に“蛇紋岩化作用”。

#カガク。#生命誕生。#分子。#生体分子。#宇宙。#地球。#新刊。“元素・分子が登場する本を読もう！” 講談社ブルーバックス「生命と非生命のあいだ　地球で「奇跡」は起きたのか」掲載分子等の紹介開始。JmolトピックNo.1228 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/dSSRmraRL1

#カガク。#医薬。#分子。#生体分子。#新刊。“元素・分子が登場する本を読もう！” 化学同人「奇跡の薬16の物語」のChem-Station記事が出ました!! 化合物作業中のJmolトピックNo.1244に追記し，少し分子も追加。p.8には“「オクタノール／水」分配係数”（緑枠）も出ています。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/NbMVKApdwP

#カガク。#生体分子。#分子。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。既報PDBデータのCell Research誌の論文が一昨日出ました。画像はPDB 8XOF（他に8XOG・8XOH・8XOI・8XOJ公開）のR鎖とそのPDBsumデータ，阻害剤Lys01が結合したGPR30。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/YWMBxWg1lz

#カガク。#生体分子。#分子。膜タンパク質。鍵と鍵穴。グラデーション。昨日公開のPDB 9B8Z（他に9B8W・9B8X・9B8Y・9B90・9B91・9B92・9B93・9B94公開）のPDBsumデータ，デカバナジン酸（decavanadate）が結合したTRPM4チャネル。JmolトピックNo.779に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/mHSKaen7iy

#カガク。#生体分子。Nature ハイライト「生化学：一本鎖DNAのアニーリングは開いたRAD52環に一本鎖DNAが巻きつくことで開始される」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8RIL・8RJ3・8RJW・8RK2。

#カガク。#生体分子。#分子。Nature ハイライト「構造生物学：細胞内にリン脂質の原料を運び入れる輸送体の作用機構」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8UBW・8UBX・8UBY・8UBZ・8UC0。

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。Nature ハイライト「構造生物学：FLVCR2は血液脳関門のコリン輸送体である」 natureasia.com/ja-jp/nature/h… PDBデータ8VZO・8VZN。

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。未公開PDBデータ8YR2・8Y95・8Y92・8Y8Z・8Y93・8Y90・8Y91。

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。鍵と鍵穴。グラデーション。本日公開のPDB 8WGU（他に8WGS・8WGT公開）のA鎖とそのPDBsumデータ，compound 20が結合したトランスサイレチン。緑・ピンク拮抗。JmolトピックNo.819に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/VeUzPS9gPe

#カガク。#生体分子。#分子。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。本日公開のPDBデータ354件の中から8FYE（他に8FY8・8FYL・8FYT・8FYX公開）のR鎖とそのPDBsumデータ，4-F,5-MeO-PyrTが結合したセロトニン受容体5-HT1AR。緑優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/Yv8aVmKEGq

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。GPCR。未公開PDBデータ8K9L・8K9K。

#カガク。#医。#生体分子。“一般名は「セマグルチド」”。

#カガク。#生体分子。#分子。#医薬。GPCR。未公開PDBデータ8K9L・8K9K。

#カガク。#生体分子。#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"にチャレンジ2件目のタンパク質＋DNAの計算例，AlphaFold3の使い方（PDB 1GT0を例に）や参考ページをecosci.jpに載せました。 ecosci.jp/pdb/iPS_1gt0.h… pic.twitter.com/aiTyfaE0zN

#カガク。#生体分子。#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"にチャレンジ2件目，タンパク質＋DNAの計算結果画像修正。データ入力時にミスがあったか不要データあったので削除してスッキリ。明日分子構造参照可能にします。 pic.twitter.com/ailXGKpeXf

#カガク。#生体分子。#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"。ここ数日間格闘。

#カガク。#生体分子。#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"にチャレンジ2件目，タンパク質＋DNAです。3Dプリンタ模型作成済みのPDB 1GT0で。1枚目画像上段は配列入力画面，下段は計算結果です。画像2枚目はPDB 1GT0の既報例。 pic.twitter.com/C4RnBiB22R

#カガク。#生体分子。#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"初試用データをWebページにアップ。PDB 3HCDのA鎖とAlphaFold 3構造（構造参照可能に）とのPyMOLによる重ね合わせ。リガンド含む構造取得可能のAlphaFill構造（昨年3Dプリンタ模型作製）との比較を画像で。 ecosci.jp/AF/#P11086 pic.twitter.com/9ZOPxrdmzf