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#カガク#生体分子#計算。多数のニュースが出ている #AI によるタンパク質の高次構造推定の重要性,昔Chimeでこんな図。αヘリックス(ピンク)とβシート(黄色)。 ecosci.jp/s/ pic.twitter.com/d9xURAt8Vl

Yoshio HONMA (本間善夫) @ecochem

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#カガク#医#環境#分子#感染。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)。新潟日報「化学物質過敏症」 - YouTube youtube.com/watch?v=rTd4EW… “ウイルス禍で体調を崩さないか心配”。

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#カガク#生物#深海#極限環境生物学。朝日「室戸沖の海底下1200メートル、温度120度に微生物」 bit.ly/2VBmVoE “高温でも生きられる超好熱性のメタン生成菌が活動していることがわかった”。

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#カガク#医#生体分子#感染。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)。NIH。スパイク糖タンパク質。ACE2。中和抗体。Nature“SARS-CoV-2 neutralizing antibody structures inform therapeutic strategies” go.nature.com/3gjRmcF PDBデータ7K8M~7K90。

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【Jmolトピック1000件へあと1歩です!】 #カガク#生体分子#分子#生物#光。分子進化。鍵と鍵穴。グラデーション。JST「1億年前のホタルの光を再現」よりJmolトピックNo.999 bit.ly/3ohDOkr DLSA結合ホタルルシフェラーゼ6K4Cと同PDBsumデータ(ルシフェリン結合6K4Dとの比較)。 pic.twitter.com/nbFQMUXlUO

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#カガク#生体分子#分子。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。既報データのPDBsumデータ追加。EROCOC17+4とインバースアゴニストZM241385が結合したアデノシンA2A受容体PDB 6LPJ。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ どちらも緑優勢。 pic.twitter.com/rK6pqe2ks5

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#カガク#環境#分子#ノーベル賞。“人新世”(アントロポシーン/アントロポセン)。

小林良彦(こばやしよしひこ)@yoshikoba113

今日(12月3日)はパウル・クルッツェン博士(1933~)が生まれた日。オランダ出身の大気化学者。オゾンの研究により、1995年のノーベル化学賞を受賞。詳しくは→bit.ly/3g2WG3J。人類が地球に重大な影響を与え始めた地質時代「人新世(アントロポシーン)」の普及者でもある。#地球 #環境

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#カガク#細胞#生体分子。Nature v588 n7836「Cover Story: 時間を巻き戻す:網膜細胞の再プログラム化によって可能になった老化に関連した視力障害からの回復」go.nature.com/33FKrVM“今回D Sinclairたちは、網膜神経節細胞に山中転写因子のうち3つ(OSK;Oct4、Sox2、Klf4)を発現させると…”。

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#カガク#生体分子#計算#AI。既報がGIGAZINEに。『タンパク質の「フォールディング問題」とは何なのか?』 bit.ly/3qn7yOH “DeepMindはその発表の中で「フォールディング問題を解決した」と主張…クロフォード氏は「DeepMindの主張は単純すぎると思いますが、いずれにせよ画期的…”。

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#カガク#生体分子#分子#医薬。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。既報PDB 7D7Mのプレスリリースと論文PDFが公開されたので図を再掲。Gタンパク質を除いたA鎖とそのPDBsumデータ(右は別論文データ),プロスタグランジンE2受容体4。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/InvMlmpCU2

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#カガク#生体分子#分子#医薬#感染#ノーベル賞。PDBj「今月の分子 255: C型肝炎ウイルス プロテアーゼ/ヘリカーゼ」をJmolトピックNo.981に追記。 bit.ly/3d9lJ3U 緑枠がそこに出てくるPDBデータ,最下段が今回追加の1CU1(C型肝炎ウイルス由来のプロテアーゼ/ヘリカーゼ NS3)。 pic.twitter.com/Fn8QnCN9t0

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#カガク#生体分子#分子。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。亀C-C-N。本日公開のPDBデータ329件の中から7BU6(他に7BTS・7BU7・7BVQ公開)のA鎖,ノルアドレナリン(ノルエピネフリン)とナノボディ6B9(図では除く)が結合したβ1アドレナリン受容体(β1AR)。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/jyFraxDKpa

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#カガク#医#生体分子#感染。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)。D614G変異。

Nature ダイジェスト/編集部@NatureDigest

【コロナウイルスの変異を理解する | Natureダイジェスト12月号】SARS-CoV-2系統の中でみるみるうちに優勢となったD614G変異型。この変異はウイルスの感染性と関連しているとみられる。今後生じるだろう変異が免疫反応をすり抜けるかどうかを探る手掛かりになるかもしれない。 natureasia.com/ja-jp/ndigest/…

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#カガク#医#生体分子#感染。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)。本日公開のSARS-CoV-2由来PDBは7KRXほかなんと56件で,計616件。 pdbj.org/featured/covid… pic.twitter.com/4PZu1cPZuh

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!。#カガク#生体分子#医薬#がん。朝日「オプジーボ使用後に3人死亡 因果関係否定できず」 bit.ly/3ocQqJw “がん免疫治療薬「オプジーボ」(一般名・ニボルマブ)”。

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#カガク#生体分子#分子。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。プロスタグランジンE2が結合したプロスタグランジンE2受容体4(EP4)PDB 7D7MのPDBsumデータ追加。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ 論文未出。右は別研究データで「川上モデル|鍵と鍵穴模型」作成。 pic.twitter.com/Uh3jZReDjh

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#sccj2020#カガク#ツタエル#生体分子#分子#原子#計算#3Dプリンタ。日本コンピュータ化学会@オンライン版サイエンスアゴラ動画は期間中500超のアクセス。広報に苦労しましたがお陰さまで。

サイエンスアゴラ事務局(公式)@ScienceAgora

「サイエンスアゴラ 2020 振り返り」の中で「10日間のYouTube総再生回数は約16,700回」とお伝えしていますが、その後集計漏れなどが判明いたしました。追って正確な数字を公開させていただきますので、しばらくお待ちいただきますようお願いいたします。

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【Jmolトピック1000件へあと2歩!】 #カガク#生体分子#分子#感覚。グラデーション。JmolトピックNo.998 bit.ly/3fUmOOd 既報@DIME記事「尿意を知らせるタンパク質の存在が明らかに」よりイオンチャネル(機械受容チャネル)PIEZO2タンパク質構造例PDBA 6KG7(α炭素とリガンドのみ)。 pic.twitter.com/fffP7ieGSY

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#カガク#生体分子。やはり何もかもタンパク質のお陰。@DIME「尿意を知らせるタンパク質の存在が明らかに、米スクリプス研究所が発見」bit.ly/3ofHTFF “PIEZO2と呼ばれるこのタンパク質は、膀胱が尿で満たされて排出が必要になったときに、それを感知する2種類の細胞の働きを助ける役割…”。

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#カガク#生物#恐竜#化石。ナショジオ『14年間隠されていた「決闘する恐竜」化石、ついに表舞台へ 組み合うティラノサウルスとトリケラトプス、謎は解明されるか』 nkbp.jp/3lpEdj1

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#カガク#生体分子#医#ゲノム編集。CRISPR。NEDO「世界初、新規ゲノム編集技術「TiD」で植物の遺伝子改変の有効性を実証 ―日本のバイオインダストリー推進の原動力として期待―」 bit.ly/2Jh9Yhk “CRISPR-CasタイプI-D(TiD)”,“Cas10dを含んでおり、二本鎖DNAに結合する特徴を持つ”。

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#カガク#生体分子#計算#AI。Scienceにも。“‘The game has changed.’ AI triumphs at solving protein structures” bit.ly/39uOBnp これもヒトが目に見えない分子を「飼いならす」(明石書店)の一端。

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#カガク#生体分子#計算#AI。取り上げているニュース多数。Nature“‘It will change everything’: DeepMind’s AI makes gigantic leap in solving protein structures” go.nature.com/3mry4UT

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#カガク#ツタエル#生体分子#分子。2020師走突入,ecosci.jp模様替え。今後も日本コンピュータ化学会@サイエンスアゴラ2020動画と拙作ロングバージョン公開。IEモードEdgeでも参照できるJmolページを来年もよろしくお願いします。 検索語“冬”で短大家庭科教職時代の遺産。 pic.twitter.com/z3m0aeKh7d

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#カガク#生体分子#分子。非GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。JmolトピックNo.995にPDBsumデータ追加。 bit.ly/3lHo2i0 レチナールが結合したロドプシンホスホジエステラーゼPDB 7D7Q。膜貫通ヘリックスが8本(GPCRは7本)。周辺アミノ酸多く緑優勢。 pic.twitter.com/RLIKAMimHu

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#カガク#生体分子#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。旧JmolトピックNo.992にPDBsumデータ追加。 bit.ly/3eMukdv アンタゴニストGW9662と作動薬フェノフィブリン酸が結合したペルオキシソーム増殖剤活性化レセプターα(PPARα)PDB 6L36。昭和薬科大学の研究グループによる。緑優勢。 pic.twitter.com/sXhKCXpWPO

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#sccj2020#カガク#ツタエル#生体分子#分子#計算。グラデーション。ecosci.jp公開動画「3Dプリンタで見るタンパク質と分子の【鍵と鍵穴の関係】」ロングバージョン youtube.com/watch?v=eS-rOO… 最近の話題から:2020年ノーベル生理学医学賞(C型肝炎ウイルス)とノビチョク剤。 pic.twitter.com/UzBHfdveh3

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#sccj2020#カガク#ツタエル#環境#生体分子#分子#計算#3Dプリンタ。鍵と鍵穴。グラデーション。日本コンピュータ化学会@オンライン版サイエンスアゴラ2020動画5編目「3Dプリンタで見るタンパク質と分子の【鍵と鍵穴の関係】」のロングバージョン公開。 youtube.com/watch?v=eS-rOO… (続く) pic.twitter.com/6smVQxAsjM

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#カガク#ヒト#ツクル#元素。ビッグヒストリー。「飼いならす」的発見。ナショジオ「氷原が解けて過去6千年分68本の矢が見つかる、ノルウェー 北欧のトナカイ猟は新石器時代からバイキング時代までにこう変遷した」 nkbp.jp/3fQ1ERu “鉄製の矢じり”など。Fe。

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#カガク#これからの日本#オンライン。長沼 毅さんもご登壇。12/2開催,参加費無料。

長沼毅@NaganumaTakeshi

12/2(水)14:30~、web番組に出演させて頂きます、参加費無料(先着1000名)! neo.co.jp/miraikaigi/202… 人のための組織のあり方を徹底する番組「NEOJAPAN未来会議」にパネリストとして出演させて頂きます! 事前登録が必要になりますので、ご興味がある方は、是非登録をお願いします。

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#カガク#映画。開催日未定の次回サイエンスカフェにいがた『原子を見てみよう』ゲストの山崎詩郎さんが翻訳等科学監修を担当された映画「TENET」,社会学者の宮台真司さんが『TENET テネット』評! 前編 bit.ly/33qizVL 後編 bit.ly/2VbU0Hy

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#カガク#生体分子#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。RCSB PDBサイトではJSmol表示も可能。スクリプトはJmolと共通,分子上右クリックメニューで表示できるコンソールに拙サイトのソースからコピペ(必要に応じて自分で加工)してRUNすれば任意の表示が可能。画像は今月の分子Adenylyl Cyclase。 pic.twitter.com/vzUflfpyzg

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#カガク#生体分子#分子。EdgeでJmol表示!! 『Microsoft Edge の Internet Explorer モード』 bit.ly/3nV5Zp2 画像はJmolトピックNo.996。 pic.twitter.com/QS0yyePOwo

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#カガク#医#生体分子#感染#メディア。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)。某ニュースサイトでニューピロリンを誤記,訂正依頼で直ったがその記事を転載したニュースでは誤記のままで検索すると出てくる。

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#カガク#医#生体分子#感染#VR。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)。先ほど紹介のYouTube動画を拙サイト新型コロナウイルス情報ページに埋め込み。 ecosci.jp/COVID-19/ pic.twitter.com/2qaru2t9x9

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#カガク#医#生体分子#感染#VR。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)。COVID19 in VR: RCSB Protein Data Bank Biocurator Joins Us Inside Nanome - YouTube youtube.com/watch?v=KxiNt2…

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再投。#sccj2020#カガク#ツタエル#生体分子#分子#計算#3Dプリンタ。日本コンピュータ化学会@オンライン版サイエンスアゴラ2020動画5編目「3Dプリンタで見るタンパク質と分子の【鍵と鍵穴の関係】」のロングバージョン昨日公開。 youtube.com/watch?v=eS-rOO… 有機概念図説明,公開パワポと。 pic.twitter.com/SBZJvkjXgn

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#カガク#医#計算#スパコン#感染。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)。毎日放送『スパコン「富岳」の新分析!“飛行機・タクシー”での飛沫は?“野外”にもリスクが』 bit.ly/3fCeClN

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#カガク#沖縄#高分子#環境#生物#拡散#マイクロプラスチック。Asahi Shimbun GLOBE「マイクロプラスチックが海の生物を変える? 沖縄の海を調べた結果」 bit.ly/39eonoY

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#sccj2020#カガク#ツタエル#生体分子#分子#計算#3Dプリンタ。日本コンピュータ化学会@オンライン版サイエンスアゴラ2020動画に続き同5編目のロングバージョンをecosci.jpトップページに埋め込み。 pic.twitter.com/L9PjzHkKIh

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